装备SS-N-27反舰导弹系统的舰艇利用通用的火控系统为导弹制定飞行任务，并将其输入导弹，进行射前准备工作。所使用的导弹均使用通用的岸基系统进行例行检查和维护。
从水面舰艇或潜艇发射后，3M-54E和3M-54E1按照相似的弹道飞行。当导弹爬升至150米高度时，固体助推器被抛掉，弹体下的进气口伸出，吸气式主发动机启动。同时，弹翼和尾翼伸出，导弹下降至海平面以上10~15米的巡航高度飞行。
当距目标30~40千米时，导弹再次爬升至一个较高的高度并启动其ARGS-54主动雷达导引头。ARGS-54雷达的长度为70厘米，直径42厘米，重量40千克(不包括天线罩)，最大作用距离为60千米，可在4毫米/秒的降雨环境和5~6级海况下使用。
导引头在探测到目标后，便锁定目标，3M-54E以2.9马赫的速度飞行，在距目标20千米时下降至3~5米的高度，以超声速攻击目标。3M-54E1则以高亚声速攻击目标。
3M-14E的使用与美国“战斧”巡航导弹有某些相似；而91RE1和91RE2的使用分别与美国的“萨布洛克”和“阿斯洛克”反潜导弹几乎一样。