关于亲子鉴定的机构主要还是看鉴定资质和机构的实验室操作经验。
法院要启动亲子鉴定程序，首先要有当事人一方的申请，其次要征得另一方的同意。在当事人没有申请的前提下，即使法官对案情有所怀疑，也不能主动启动鉴定程序。
《批复》规定：“一方当事人要求作亲子鉴定的，或者子女已超过三周岁的，应视具体情况，从严掌握，对其中必须作亲子鉴定的，也要做好当事人及有关人员的思想工作。”在一方当事人申请鉴定，而另一方当事人拒绝鉴定的情况下，根据《批复》从严掌握的原则，法院仍然不能启动亲子鉴定程序。
这是因为亲子鉴定需要提供父、母、子三方基因样本来鉴定，基因样本的提供涉及人身权问题，在目前法律没有明确规定的前提下，不能采取强制性的手段获取样本