一个记分周期内违章被扣满12分，公安机关交通管理部门会扣留其机动车驾驶证。
机动车驾驶人应当在15日内到驾驶证核发地或者违法地的公安机关交通管理部门参加为期7日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。
参加学习过后，车辆管理所应当在20日内对其进行道路交通安全法律、法规和相关知识考试。考试合格的，记分予以清楚，并且返还其驾驶证；考试不合格的，继续参加学习和考试。
若是拒绝参加学习和考试的，由公安机关交通管理部门告之驾驶证停止使用。
《机动车驾驶证申领和使用规定》第五十八条：机动车驾驶人在一个记分周期内累积记分达到12分的，公安机关交通管理部门应当扣留其机动车驾驶证。
机动车驾驶人应当在十五日内到机动车驾驶证核发地或者违法行为地公安机关交通管理部门参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。机动车驾驶人参加学习后，车辆管理所应当在二十日内对其进行道路交通安全法律、法规和相关知识考试。
考试合格的，记分予以清除，发还机动车驾驶证；考试不合格的，继续参加学习和考试。拒不参加学习，也不接受考试的，由公安机关交通管理部门公告其机动车驾驶证停止使用。
扩展资料：
若是扣分超过12分及以上，那么处理违章时交警会扣留你的驾驶证，让你去指定的地方进行交通法规的相关知识学习，为期七天。交上考试费用，最后一天参加科目一考试，和当初考驾照是一样的。
考试合格后，发放考试成绩单凭证，再去领取驾驶证，驾驶证扣分清零。若是扣分超过24分的，不光要进行科目一考试，还要进行科目三考试，全部合格后，才可以领回驾驶证。
所以尽量不要让驾驶证扣满12分。对于一次性扣12分的违章，那是没有别的办法，扣分又不能拆分，只能扣完后去重新学习。
而对于一年内有好几个违章，扣分加起来超过12分了，这种情况就不要用一个驾驶证去扣了，有两个方法：
一、在驾驶证快要到期清零的时候，去处理一部分违章，要算好了，扣尽量多的分，但不要超过12分。到了下一个记分周期，再去处理其他违章。
二、因为车可能不是一直一个人开，如果别人开你车违章了，那就要用别人的驾驶证去处理。所以可以用两个或三个驾驶证，一次性处理完毕。
有三个问题要注意：
1、一个记分周期内，一辆车最多可接受三个驾驶证扣分，一个驾驶证最多可以给三辆车扣分。所以若是违章太多，三个驾驶证分都不够扣了，那只能去重新学习了，用一个驾驶证扣掉所有的分。
2、同时有扣分和罚款的违章，罚款也需要交上，到了第二个记分周期才会清零。
有的人因为时间紧，在记分周期最后几天去处理违章，只扣了分，但罚款一直没有交，几天后到了第二个记分周期，结果没有清零，实在是太亏了。若是没有时间，最好找一个既能扣分，又能交罚款的违章处理点。
3、这种批量处理违章，最好等记分周期快结束的时候处理，提前三四天。若是处理太早，驾驶证被扣了11分，某天开车又违章被交警当场抓到，那是要直接扣分的，分就直接扣在你的驾驶证上，结果超过12分又要重新学习。
参考资料：百度百科-《机动车驾驶证申领和使用规定》
根据《机动车驾驶证申领和使用规则》的规定：
第五十八条 机动车驾驶人在一个记分周期内累积记分达到12分的，公安机关交通管理部门应当扣留其机动车驾驶证。
机动车驾驶人应当在十五日内到机动车驾驶证核发地或者违法行为地公安机关交通管理部门参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。机动车驾驶人参加学习后，车辆管理所应当在二十日内对其进行道路交通安全法律、法规和相关知识考试。考试合格的，记分予以清除，发还机动车驾驶证；考试不合格的，继续参加学习和考试。拒不参加学习，也不接受考试的，由公安机关交通管理部门公告其机动车驾驶证停止使用。
机动车驾驶人在一个记分周期内有两次以上达到12分或者累积记分达到24分以上的，车辆管理所还应当在道路交通安全法律、法规和相关知识考试合格后十日内对其进行道路驾驶技能考试。接受道路驾驶技能考试的，按照本人机动车驾驶证载明的最高准驾车型考试。
违章超过12分，驾驶证要如何处理？这些常识新手司机需要知道