微生物的营养需求中碳源的功能为给细胞提供能源。
用于构成微生物细胞和代谢产物中碳素来源的营养物质称为碳源（carbon source）。微生物细胞中碳素含量约占干物质的50%。碳源是工业发酵培养基的主要成分之一，它既能构成菌体细胞和代谢产物，又能提供微生物生命活动中所需能量。
生产中使用的碳源有碳水化合物（糖类）、脂肪、有机酸、醇和碳氢化合物等。由于各种微生物生理特性不同，所含的碳源分解酶并不完全一致，所利用的碳源品种会存在差异。
碳源对微生物生长代谢的作用主要为提供细胞的碳架，提供细胞生命活动所需的能量，提供合成产物的碳架。碳源在制作微生物培养基或细胞培养基时有重要的作用，为微生物或细胞的正常生长，分裂提供物质基础。
常见的碳源分类：
1.糖类
工业发酵中使用的糖类可分为单糖、双糖、淀粉质类和糖蜜等。葡萄糖是工业发酵最常用的单糖，由淀粉加工制备，其产品有固体粉末状葡萄糖、葡萄糖糖浆（含少量双糖）。它们被广泛用于抗生素、氨基酸、有机酸、多糖、笛类转化等发酵生产中。
2.油脂
常见的油脂主要指动物、植物油，如豆油、玉米油、棉籽油和猪油等。霉菌和放线菌可利用油脂作为碳源。在培养基中糖类缺乏或发酵至某一阶段，菌体一般可利用油脂。在发酵过程中加入的油脂具有消泡和补充碳源的双重作用。
3.有机酸、醇
主要有乳酸、枸橡酸、延胡索酸、氨基酸、低级脂肪酸、高级脂肪酸、甲醇、乙醇、甘油等，用于单细胞蛋白（SCP）、氨基酸、维生素、麦角碱和抗生素的发酵生产。乙醇在青霉素发酵中的应用取得了较好效果。
4.碳氢化合物
石油产品可以作为某些微生物发酵的碳源。石油产品在单细胞蛋白、氨基酸、核昔酸、有机酸、维生素、酶类、糖类、抗生素等发酵中均有研究。由于成本、市场、安全性等因素投入工业化生产的很少。
微生物常用的碳源物质分为有机碳源和无机碳源两种。各种糖类、蛋白质、脂肪、有机酸等都是有机碳源。微生物生长繁殖或积累代谢产物的营养基质。任何培养基都需要含有微生物所需的能量、碳、氮、矿物质、水和生长因素，但不同营养类型和类型的微生物对营养元素的要求却大不相同。
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