肛周脓肿确诊后应该及时的切开排脓，控制感染，以免脓肿向其他的间隙扩展，甚至产生复杂性肛瘘。手术的原则是定位要准确，引流要彻底，避免损伤括约肌预防肛瘘的形成，一般采用腰麻或者局部麻醉。术前准备有：第一，术前二到三天进食少量的软饭，温水坐浴每日两次。第二，一般可以给予肠道准备。第三，预防性使用口服抗生素，肛周脓肿手术的适应症是，包括坐骨直肠窝脓肿、直肠后脓肿、高位肌间脓肿、骨盆直肠脓肿等等。手术的大体步骤：第一，局部的消毒铺巾。第二，在脓肿波动最明显处，沿直肠纵轴方向做放射样切开。第三，排尽脓液后对不同脓肿分别做处理，例如对低位的肛周脓肿均采用一次性切开引流。第四，对于高位的脓肿至脓肿最高，以探针最薄处穿入直肠并以食指插入肠管做引导，引入丝线两端夹紧后钳夹，放置凡士林油条等等