小儿急性胰腺炎致病因素较复杂，有时可突然发病，难以确定其病因。其发病原因与胰液外溢入胰腺间质及其周围组织有关。现多认为与病毒感染、药物、胰分泌管阻塞及某些全身疾病或暴饮暴食有关。以下因素可引起小儿急性胰腺炎。
（1）感染因素，继发于身体其他部位的细菌或病毒感染：包括流行性腮腺炎病毒、巨细胞病毒、肝炎病毒、EB 病毒、柯萨奇病毒、ECHO 病毒、肺炎支原体、结核杆菌等致病微生物。对小儿来说，尤其多见的是流行性腮腺炎病毒感染。在一般情况下，因感染致病的胰腺炎症状都比较轻，常为亚临床型，可随感染痊愈而自行消退。
另外，沙门菌或链球菌败血症患者亦可发生急性胰腺炎，蛔虫阻塞胰管导致的急性胰腺炎在小儿中也是较常见的。
（2）上消化道疾患或胆胰交界部位畸形。其中，先天性胰管畸形可谓是一个比较特殊的原因，在小儿急性胰腺炎患者中，此种原因较为多见。在人类正常胚胎发育过程中，主胰管和副胰管是相交的，胰液主要通过主胰管经十二指肠乳头进入肠腔，如果胚胎发育中出现某种故障，导致主胰管和副胰管不相交，而副胰管较细，十二指肠内副乳头又相对较小，可能使胰液排泄不畅，从而引起胰腺炎。对于青少年急性胰腺炎患者，如果找不到其他诱发原因，要考虑到这一点。还有一种先天性畸形是胆道扩张症，如胆总管囊性扩张或非囊性扩张症，这种畸形导致的胰腺炎占10% ～ 35%，尤其对小儿胰腺炎要考虑到这一原因，它造成的胰腺炎多数不太严重，经逆行胰胆管造影术（ERCP）检查即可确诊。
（3）药物诱发：应用大量肾上腺糖皮质激素、免疫抑制剂、吗啡及在治疗急性淋巴细胞白血病时应用的左旋门冬酰胺酶等均可引起急性胰腺炎。
（4）并发于系统性红斑狼疮、过敏性紫癜和甲状旁腺功能亢进症。
（5）还有上腹部钝伤等。仍有半数病例无肯定的致病因素。