学校设有商学院、机械电子技术学院、计算机信息技术学院、外国语学院、传媒与设计学院、继续教育学院、旅游与酒店管理系、中国语言系、公共教学部（体育教学部）、中专部等六院两系两部，开设40多个本、专科专业和30个普通高职专业。此外，学校还设有北京工商大学新疆函授站、中北大学新疆函授站、浙江工商大学新疆函授站、自治区国家职业技能第一、第八鉴定所，自治区普通话培训测试工作站、国家经贸委新疆远程教学站。新疆职业大学专业明细：
商学院专业：1.资产评估管理2.会计电算化3.市场营销4.电子商务5.工商企业管理6.连锁经营管理
7.物流管理8.人力资源管理
传媒与设计学院专业：
1、宝玉石鉴定与加工技术
2、宝玉石鉴定与加工技术（玉雕设计）
3、文秘（涉外文秘）
4、广告设计与制作
5、新闻采编与制作
6、法律事务
计算机信息技术学院专业
1、信息安全技术专业
2、计算机网络技术专业
3、计算机信息管理专业
4、计算机应用技术专业
烹饪与餐饮管理学院高职专业：
1、烹饪工艺与营养专业
2、烹饪工艺与营养（方向：西餐工艺与营养）专业
机械电子学院专业
1、汽车运用技术
2、物业管理
3、焊接技术及自动化
4、机电一体化技术5、电气自动化技术
6、应用电子技术
旅游与酒店管理学院专业：
1、空中乘务
2、旅游管理
3、酒店管理
4、航空服务
5、涉外旅游
中国语言学院专业：1、汉语专业（翻译）2、汉语（商务）3、初等教育（双语师资）
外国语学院专业：1、应用俄语2、商务英语3、旅游英语
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