结局动画中，先知似乎于灵山岛隐居中，收音机拨放的演讲内容也暗示前作的CIA特工史崔克兰当选参议员，并领导重建秩序。其纳米服中的神经块被移除，衣服的外层变成了先知原来的身体，使他重获新生。他走到海滩，扔掉了前小队的狗牌，放弃了他的过去，并决定从此开始用他的真名为“劳伦斯·巴恩斯”，故事也就此结束。
剧情简介——
《孤岛危机2》事件后，赛可和先知在世界各地寻找Ceph的最终领导者Alpha Ceph。CELL公司利用纽约之战中掌握的外星人科技和无限能量源已经逐步发展成地球统治的实权政府，他们将先知冷冻起来，抓捕所有的纳米服士兵，剥离他们的纳米服，恢复存储在其中的Ceph基因。
同时，当市民们被告知这些纳米装置是用作提供保护与净化功能时，事实上都是CELL企业为掌控全世界一步步所设下的陷阱；于是部分人民成立了反政府游击队。由克蕾尔·方谭丽带领的反抗军因发现潜藏在CELL企业所建造之供隔离使用的纽约纳米圆顶背后的邪恶动机；
于是从冰冻箱救出唯一着有奈米服的先知。赛可也是反抗军的一员，之前曾是纳米服的持有者。他告诉先知CELL的X系统供应整个世界的电力，位于废弃的纽约。那些付不起电力的人将成为奴隶。反抗军希望破坏X系统，让全世界获得自由。
扩展资料：
人物介绍——
1、先知（Prophet）
一代中暴龙小队的队长，在孤岛危机1中遭到Ceph感染，基因受到改造，因此可以使用Ceph的武器。2代中将纳米生化装让渡给重伤垂死的陆战队员阿卡特兹穿上，并随后举枪自尽，但先知的意识仍留存于纳米生化装中，并持续对阿卡特兹的决策做出影响。
2、赛可（Psyco）
前暴龙小队成员，曾在英国特种空勤团（SAS）中服役，性格冲动、暴躁。在3代中已经失去了纳米生化装，据其透露是被Cell企业强行以手术取下，由于纳米生化衣与使用者之间的深层链接，导致在手术过程中承受了莫大的痛苦，也留下了严重的后遗症，因此誓言揪出当初对他动手术的Cell人员进行复仇。
3、克蕾儿
反抗军的指挥官，本身非军人出身，但仍表现得非常出色。与赛可的关系相当密切。曾强烈质疑先知究竟是何种身分。
赛可没有死，主角纳米服进行了终级进化，变成了和外星人一样的外骨骼，但是比外星人的更先进，可以任意改变外形。所以，先知把外形改变成了以前巴恩斯的长像，最后成为了一个全新的物种，既不是人类也不是外星人。
主角面对侵略而来的异形大军感到无能为力，眼前耳边回放看过往的一幕幕，最终主角选择最后一搏利用卫星兵器成功的机会了异形的战舰。
主角从太空向地球坠落，纳米装甲在同大气的摩擦中燃烧并开始适应性基因重组。最终主角落在了一个岛上，醒来的主角发现自己的纳米装甲不见了，但它的皮肤却纳化。
扩展资料
背景剧情：
《孤岛危机3》故事发生在上作《孤岛危机2》之后，纽约已经包裹在Nanodome当中的城市，成为热带雨林，长满树木，茂密的沼泽地和湍急的河流.
其中分成为七个不同的和变化莫测的环境，《孤岛危机2》当中的先知，研发出一个致命的复合弓箭，增强的纳米服和毁灭性的外来高科技，成为这个星球上最致命的猎人。
纽约树立起了巨大的保护屏障来保护城市，政府宣传的目的是为了保护人类不受外星人的影响和袭击，实际上这个保护屏障的背后是CELL企图用武器和科技征服世界的野心。
因此二代中继承了先知名字和意志的主人公,本名阿兹卡特的陆战队成员跟随前暴龙小队成员，在《孤岛危机：弹头》中担任主角的Psycho一起在该作中挑起抵抗CELL的重任。
本回答被网友采纳就这样 塞克以为主角死了 但是呢 我们的主角 毁掉了 章鱼人虫洞飞船 然后坠入地球
最后你会看到 主角的肉体完全跟纳米生化衣 合体了 也颖脱了 孤岛危机2 说的 生化衣的本质就不是作为一套衣服 而是人体 第二层皮肤 先知和生化衣 完全进化 不会分开本回答被提问者采纳
赛可没有死，主角纳米服进行了终级进化，变成了和外星人一样的外骨骼，但是比外星人的更先进，可以任意改变外形。所以，先知把外形改变成了以前巴恩斯的长像，最后成为了一个全新的物种，既不是人类也不是外星人。
主角面对侵略而来的异形大军感到无能为力，眼前耳边回放看过往的一幕幕，最终主角选择最后一搏利用卫星兵器成功的机会了异形的战舰。
主角从太空向地球坠落，纳米装甲在同大气的摩擦中燃烧并开始适应性基因重组。最终主角落在了一个岛上，醒来的主角发现自己的纳米装甲不见了，但它的皮肤却纳化。
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背景剧情：
《孤岛危机3》故事发生在上作《孤岛危机2》之后，纽约已经包裹在Nanodome当中的城市，成为热带雨林，长满树木，茂密的沼泽地和湍急的河流.
其中分成为七个不同的和变化莫测的环境，《孤岛危机2》当中的先知，研发出一个致命的复合弓箭，增强的纳米服和毁灭性的外来高科技，成为这个星球上最致命的猎人。
纽约树立起了巨大的保护屏障来保护城市，政府宣传的目的是为了保护人类不受外星人的影响和袭击，实际上这个保护屏障的背后是CELL企图用武器和科技征服世界的野心。
因此二代中继承了先知名字和意志的主人公,本名阿兹卡特的陆战队成员跟随前暴龙小队成员，在《孤岛危机：弹头》中担任主角的Psycho一起在该作中挑起抵抗CELL的重任。