终末消毒处理流程如下：
（一）在出发前，应检查所需消毒工具、消毒药械和防护用品，做好准备工作。
（二）消毒人员到达疫点后，首先查对门牌号和病人姓名，并向有关人员说明来意，做好防疫知识宣传，禁止无关人员进入消毒区域内。
（三）对脱掉的外衣应放在自带的布袋中（不要放在污染或可能受到污染的地方）。穿工作衣、隔离服、胶鞋（或鞋套），戴上医用防护口罩（N95）、帽子、防护眼镜、一次性乳胶手套等。
（四）仔细了解病人患病前和患病期间居住的房间、活动场所，用过的物品、家具，吐泻物、污染物倾倒或存放地点，以及污水排放处等，据此确定消毒范围和消毒对象。根据消毒对象及其污染情况，选择适宜的消毒方法。
（五）进入疫点时，应先用喷雾消毒的方法在地面消毒出一条1.5米左右宽的通道，供消毒前测量、采样和其他处理用。
（六）测算房屋、家具及地面需消毒的面积和体积。
（七）必要时，由检验人员对不同消毒对象进行消毒前采样。
（八）消毒前应关闭门窗，将未被污染的贵重衣物、饮食类物品、名贵字画及陈列物品收藏好。
（九）对室内空气和物体表面进行消毒。
（十）室内消毒后，若可能存在污染，对厕所、垃圾、下水道口、自来水龙头、缸水和井水等进行消毒。
（十一）疫点消毒工作完毕，所用消毒工具表面用消毒剂进行擦洗消毒。对消毒人员穿着的工作服、胶靴等进行喷洒消毒后脱下。将衣物污染面向内卷在一起，放在布袋中带回消毒。
（十二）必要时，到达规定的消毒作用时间后，由检验人员对不同消毒对象进行消毒后采样。
（十三）填写疫点终末消毒工作记录。
（十四）离开病家前，叮嘱病家在达到消毒作用时间后开窗通风，擦拭打扫。
终末消毒注意事项
入户终末消毒操作时，为保证人员安全，家庭成员需要在消毒结束以后才能够进入，消毒队员本身需要做好个人防护。消毒时需要选择安全有效的消毒剂和消毒方法，针对不同物品、材质分别采取不同的消毒方法。
要保护好贵重物品并尽量减少对所有消毒对象的损害，对家中库存的感染者确实没有使用的物品也可采取诸如密闭封存、长时间静置等无害化处理方式。