体育教育运动训练一系是在2003年1月学校进行系科调整后，由原球类系、体操系及武术系的游泳教研室合并而成，是在当前教育改革的新形势下，为将上海体育学院建设成为国际知名，亚洲一流的体育大学孕育而生的。重新整合后的体育教育运动训练一系，目前本科设体育教育、运动训练两个专业，硕士研究生设体育教育训练学专业。现所设专业方向有足球、篮球、排球、乒乓球、羽毛球、网球、软式网球、橄榄球、竞技体操、艺术体操、健美操、体育舞蹈、水球、游泳等。全系有教职工80余名，其中在职教授7名、副教授26名；其中博士生导师3人、硕士生导师20人。现在校研究生近100名，本科学生近1500名。
一系目前设有竞技体操、艺术健美操、篮球、排球、足球、乒乓球、羽网球、游泳等八个教研室和学校体育教育研究中心、中国乒乓球协会培训中心、中国羽毛球协会培训中心等三个中心，目前正在积极筹办体育教育研究所。
体教运训二系是在上海体育学院建院50周年之际，进行系科调整后于2003年1月1日成立的，下设田径教研室、重竞技教研室、体能训练教研室三个部门。
现有教职员工41人，其中教授4人、副教授7人、讲师20人、助教4人、行政人员6人；博士生导师2人、硕士生导师11人。
系正、副主任由吴瑛教授（博士研究生导师）、吕季东副教授（硕士研究生导师）担任。体育教育运动训练二系与竞技体校为联合党总支，总支书记高根龙，副书记刘明生。
二系在校硕士生26人，本科生843人。所设项目有田径、举重、柔道、击剑、摔跤、跆拳道。按教学计划要求，本系开设课程有田径（上）、田径（下）、中级田径、田径概论、体能训练、专项训练、保龄球、棋牌、木球、身体素质训练理论与方法、举重、健美、柔道、散打、击剑、摔跤、跆拳道等课程。承担着我院学生田径课普修教学工作、体育教育专业学生和运动训练专业学生的田径专项训练工作以及全院运动训练专业学生的体能必修课的教学工作；以及重竞技项目的教学和训练工作。
本系经过广大教师的共同努力，在教学、科研、训练和学生管理方面成绩显著。朱咏贤、杨学军、吴瑛、吕季东等教师曾参与国家体育总局重大课题研究和《田径运动高级教程》、《田径运动教程》及《田径》全国教练员岗位培训教材编写获得体育科技进步奖和优秀教材一、三等奖，王兴等教师获国家体育总局频发的体育教学成果一、二等奖，己逐步形成一支整体素质较高的师资队伍。
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