一、专业性质不同
1、生物信息学：是研究生物信息的采集、处理、存储、传播，分析和解释等各方面的学科，是，生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。
2、计算生物学：是生物学的一个分支，是指开发和应用数据分析及理论的方法、数学建模和计算机仿真技术等，用于生物学、行为学和社会群体系统的研究的一门学科。
二、研究内容不同
1、生物信息学：通过综合利用生物学，计算机科学和信息技术而揭示大量而复杂的生物数据所赋有的生物学奥秘。
2、计算生物学：运用计算机的思维解决生物问题，用计算机的语言和数学的逻辑构建和描述并模拟出生物世界。
三、研究方法不同
1、生物信息学：以数据（库）为核心，数据库的建立，生物学数据的检索，生物学数据的处理，生物学数据的利用：计算生物学。
2、计算生物学：各种计算方法已开始广泛应用于药物研究，以及研发创新的、具有自主知识产权的疾病靶标和信息学分析系统等。同时，运用计算生物学，科学家有望直接破译在核酸序列中的遗传语言规律，模拟生命体内的信息流过程，从而认识代谢、发育、进化等一系列规律。
参考资料来源：百度百科-生物信息学
参考资料来源：百度百科-计算生物学
一、研究方法不同
1、生物信息学
以数据（库）为核心
1）数据库的建立
2）生物学数据的检索
3）生物学数据的处理
4 ）物学数据的利用：计算生物学
2、计算生物学
各种计算方法已开始广泛应用于药物研究，以及研发创新的、具有自主知识产权的疾病靶标和信息学分析系统等。
同时，运用计算生物学，科学家有望直接破译在核酸序列中的遗传语言规律，模拟生命体内的信息流过程，从而认识代谢、发育、进化等一系列规律，最终为人类造福。
二、研究内容不同
1、生物信息学
2、计算生物学
1）生物序列的片段拼接。
2）序列对接。
3）基因识别。
人类长达30个亿DNA序列中只有3%-5%是基因。阐明人体中全部基因的位置，结构，功能，表达等，计算能力扮演了一个重要的角色，一个重要应用就是模拟基因表达数据集。
4）种族树的建构。
5）蛋白质结构预测。
蛋白质的很多特性,功能是和它实际的三维结构及其相关的，任意给一段蛋白质序列，生物学家就可以用传统的生物学方法求出其结构，但这不但成本高而且费时，计算生物学的蛋白质结构预测工具通过序列分析可以直接得出其结构，如，CYTO:人类T细胞中的因果蛋白质信号网络。
6）生物数据库
生物学数据量不断增长，每14个月基因研究产生的数据就会翻一番，海量的数据单单依靠观察和实验已无能为力
三、技术发展不同
1、生物信息学
生物信息学是建立在分子生物学的基础上的，因此，要了解生物信息学，就必须先对分子生物学的发展有一个简单的了解。
研究生物细胞的生物大分子的结构与功能很早就已经开始，1866年孟德尔从实验上提出了假设：遗传因子是以生物成分存在，1871年Miescher从死的白细胞核中分离出脱氧核糖核酸（DNA）。
在Avery和McCarty于1944年证明了DNA是生命器官的遗传物质以前，人们仍然认为染色体蛋白质携带基因，而DNA是一个次要的角色。
2、计算生物学
20世纪80年代计算机科学与技术发展，以及生物化学、分子生物学的系统论建立，1989年在美国召开了生物化学系统论与生物数学的国际会议，讨论了生物系统理论的计算机模型研究方法，开创了计算生物学的发展，属于早期计算系统生物学家的研讨会。
因此，后来改为国际分子系统生物学会议（ICMSB，参见第10届会议），第11届国际分子系统生物学会议在中科院-德国马普上海计算生物学研究所成功举办。
参考资料来源：百度百科－计算生物学
参考资料来源：百度百科－生物信息学
本回答被网友采纳可以参考下啊http://baike.baidu.com/view/584966.htm
http://baike.baidu.com/link?url=VRKDlWHeAbPGPiYb_fvez14XUdT1oiiadBduvaUSXehfBvzAEPZnpjQd_4BN3CmB
因为我是学生物的，所以简单点和你说吧，生物信息学就是将生物里的像蛋白质序列，DNA编码啊等等主要偏重于蛋白质和核酸的相关东西信息化，数据化，在此基础上应用计算机方法去研究。而计算生物学就是更具体地在得到这些数据或者预测这些数据的过程中去建模啊，设计算法啊，编程啊什么的。通俗点讲，生物信息学更偏生物一点，计算生物学更偏计算机一点，如果你在大学选这两个专业的话，那么在课程设置上，一个偏向生物的可能就会多点，主要点，另一个就侧重计算机领域的更多点。
但是需要注意的是，这两个的确界限越来越模糊，区别越来越小。本回答被提问者采纳