首先，土耳其是美国在中东的重要盟友，其已加入北约并正谋求加入欧盟，这决定了它与反西方的伊朗，发展关系受到根本性的制约。
另外，伊朗是叙利亚和黎巴嫩极端势力的主要后台之一，伊朗在这些地区的渗透，则也难免使土耳其感觉芒刺在背。
此外，伊朗是一个政教合一的极权国家，以什叶派伊斯兰教为国教；土耳其大部分穆斯林信仰逊尼派，但自凯末尔时代便推行政治世俗化，有时，这有助于避免和伊朗的某些冲突，但有时也可能导致意识形态冲突。
当然，两国也存在一定合作空间：
一、双方都面临库尔德人分离力量的挑战；
二、地缘上，双方都面临俄罗斯的强大压力；
三、两国都不是阿拉伯国家，在伊斯兰世界都受到阿拉伯国家的某种排斥；
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