员工违法，公司可按照其规章制度进行处罚。
如果需要接受行政处罚或者刑事处罚的，则由相应的行政机关或者司法机关给予处罚。如果员工被依法追究刑事责任的，公司可以解除与员工的劳动关系。
公司员工违反公司纪律的，按照公司的规章制度进行处理；如果员工严重违反了公司的规章制度的，那么单位可以给予该员工开除的处理，并且这种情况下单位不需要支付劳动者经济补偿金。公司员工违反公司纪律的按照公司章程的规定和公司的规章制度来进行处理。公司章程，是指公司依法制定的、规定公司名称、住所、经营范围、经营管理制度等重大事项的基本文件，也是公司必备的规定公司组织及活动基本规则的书面文件。
员工违纪的处理方式如下：
1、行政处分。警告、记过、记大过、降级、撤职、留用察看、开除；
2、辞退，解除劳动合同。即时辞退，因严重违纪而辞退、预告辞退；
3、除名。是只适用于劳动者无故连续旷工15天或一年内累计旷工30天而作的行政处理；
4、承担经济责任。扣工资不超过20%。
违纪发生后，及时搜集证据，对违纪事实进行证据固定。关于搜集和固定证据，用人单位可以采取以下方式进行：
1、通过一些书面记录、电子设备进行证据搜集和固定；
2、通过其他劳动者的证人证言及其他设备进行证据搜集和固定；
3、通过与劳动者谈话，进行电话录音；
4、 劳动者自认；
5、通过一系列证据形成证据链。
员工发生违反公司规章制度的行为，用人单位应当首先听取其所在部门领导的意见，因为所在部门对该员工最了解，也最熟悉员工的情况，由所在部门领导根据公司的规章制度提出处理意见。与违纪员工进行谈话，提出处理意见，听取员工意见。用人单位作出处理意见后，不应当直接公布，应当将处理意见告诉员工，听取员工对该处理意见的看法，应当给员工一个申辩的机会，如果员工讲得有道理，公司应当修改自己的处理意见。
综上所诉，对于员工的处理，用人单位最好对外公布，对其他员工也起到警示和教育作用，同时用人单位需要注意，对于违纪员工的处罚，用人单位最好让员工签收，同时单位留存。
【法律依据】：
《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条
用人单位单方解除劳动合同（过失性辞退），劳动者有下列情形之一的，用人单位可以解除劳动合同：
（一）在试用期间被证明不符合录用条件的；
（二）严重违反用人单位的规章制度的；
（三）严重失职，营私舞弊，给用人单位造成重大损害的；
（四）劳动者同时与其他用人单位建立劳动关系，对完成本单位的工作任务造成严重影响，或者经用人单位提出，拒不改正的；
（五）因本法第二十六条第一款第一项规定的情形致使劳动合同无效的；
（六）被依法追究刑事责任的。
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