市审计局查账主要查的内容包括：
1. 财务报表的完整性和准确性。市审计局会详细审查企业的资产负债表、利润表、现金流量表等，确认报表数据是否真实反映企业的财务状况和经营成果。同时，审计部门还会关注财务报表的合规性，检查是否遵循相关会计准则和规定编制。
2. 资金使用效率。审计部门会深入核查企业资金的使用情况，检查资金的流转效率和利用效果。这不仅涉及企业内部各部门的资金流转，也包括企业与其他经济主体的资金往来。通过这种方式，审计部门可以判断企业资金的安全性以及运营效益。
3. 内部和外部合规性检查。审计部门会审查企业的经济业务是否遵循国家的法律法规，企业内部制定的相关制度是否得到执行。此外，审计部门还会关注企业的税务问题，确保企业依法纳税，税务处理符合相关法规要求。
4. 审查经营成果的真实性和合理性。市审计局会核查企业的收入、成本、利润等关键财务指标，确认这些指标是否真实反映了企业的经营成果。同时，审计部门还会分析这些指标的变化趋势，判断企业的经营状况和发展前景。
市审计局在查账时，会对上述内容进行全面的审查和分析。通过审计，审计部门可以评估企业的财务状况、经营风险和管理效率，为政府决策提供参考依据。同时，审计也有助于促进企业规范运作，提高管理水平和经济效益。