在同一县城，年龄相同、工龄相同、升职时间大致相同的正科级公务员和正科级一般事业编工作人员，只要其在职期间的收入是一样的，退休后按照基础养老金、个人账户养老金、过渡性养老金来计算养老金的话，其养老金从理论上来说应当是差不了多少的。但这仅是理论上的，实际上并不是如此的。
一、因在职期间的收入有差别，退休后的养老金和职业年金也会有差别。
虽然正科级公务员的职务工资、级别工资、规范津贴补贴以及其他特殊津贴补贴之和，与一般事业单位正科级工作人员的岗位工资、薪级工资、绩效工资及其他特殊津贴补贴之和，是大体相当的。
但是，在县城，特别是财力不太好的县城，在发年终绩效奖的时候，公务员肯定是会有绩效奖金的，事业单位工作人员要么是没有年终绩效奖金，要么是年终绩效奖金比公务员要少，有时还不止少一点点。而年终绩效奖是计入养老保险的缴费基数的。
如果他们之间的年终绩效奖每年相差1.2万元（每月相差1000元），那么每月的养老保险缴费基数就会相差1000元。这1000元的缴费基数，既可以影响平均缴费工资指数，也可以影响个人账户余额，使得在他们在退休后的养老金方面产生差别，根据实际缴费年限及当地的社平工资的不同，少则相差两、三百元，多则四、五百元，甚至更多。当然，缴费基数相差的金额不同，退休后的养老金相差金额也就会不同。
由于职业年金是按照养老保险的缴费基数缴费的，因此，缴费基数相差1000元，也会使他们退休后每月领到的职业年金有差别。根据缴费年限的不同，差别也不一样。如果实际缴费15年后，在60岁退休，职业年金个人账户余额就会相差2.16万元（不计利息），每月领到的职业年金就会相差155元。
因此，在同一县城以正科级公务员和正科级事业编人员，由于在职时的收入有差别，使缴费基数也有了差别，从而使其退休后的养老金和职业年金也稍微有了差别。但相差不是很大，也就是相差几百元左右，一般是其养老金的10%左右。
二、因身份不同，病故后的抚恤金标准也不同。
公务员与事业单位工作人员的身份不同，退休后病故了，抚恤金也不同。按现在的抚恤金发放规定，公务员退休后病故的，其抚恤金为上一年度全国城镇居民人均可支配收入的2倍加本人死亡当月基本退休费的40倍。一般事业编工作人员退休后病故的，其抚恤金为本人死亡当月基本退休费的20倍。
即使正科公务员与正科一般事业单位工作人员的养老金一样，其病故后的抚恤金标准也相差很大，至少是一倍以上。如果他们的月养老金（基本退休费）都是5000元，上一年度全国城镇居民人均可支配收入为3万元，则公务员病故后的抚恤金为26万元。一般事业单位工作人员病故后的抚恤金为10万元。相差16万元。如果月养老金还有差别的话，抚恤金也还相应有些差别，不过比起前面的相差16万元，那差别就小很多了。
综合以上情况，正科公务员与正科的一般事业单位工作人员，由于在职时的奖金收入有差别，以及身份有差别，在退休后的养老金、职业年金方面有一些不太大的差别，但在病故后的抚恤金方面有较大的差别。
以上是个人的见解，如有不当之处，请批评指正。
事业单位在编人员和公务员都是公职人员，其福利待遇都是由国家财政全额供给，但是事业单位在编人员和公务员那个待遇更好呢？
这个没有肯定的答案，因为在市级以下基层单位，工资最高的，基本上都是事业编制技术岗人员，当然如果同级别，同工龄，同学历的基础上比较，那么公务员总体收入会比事业单位高一些，主要的区别就是事业编制人员没有车补和话补，而公务员有。
不管是事业单位还是公务员，其工资的区别主要决定因素是工龄长短、学历高低、职务大小、地区政策和身份性质，相差一年工龄大概悬殊30-50元，相差一级学历，工资大概悬殊100-300元，相差一级职务大概悬殊500-1000元，身份性质主要分为公务员、参公、事业管理、事业技术、行政工勤岗和事业工勤这几种。
其中工勤人员是工人身份，事业和公务员是干部身份，公务员和参公一样，两者比事业身份同级高500元左右，事业管理和技术又比行政和事业工勤高200-500元。
地区政策和发展情况是导致工资差距最大的，比如深圳上海地区机关事业单位年收入基本上能够达到25万以上，而西部偏远地区一个月三五千工资的大把的是，所以地区不一样，工资差别也会非常大。
像我们临近省份云南基本工资就比我们高一千多，其实距离不远，就是隔条河而已，但是地方政策不一样，工资也相差很多。
另外说说我们单位的情况吧，我们单位是乡镇政府，正科级行政机关，接近70个在编人员，其中公务员25人左右，事业编制40多人，工资最高的三个人都是事业身份，而不是公务员领导。
这三个人都是事业技术岗6-7级，也就是所谓的副高级职称，工资待遇等同于公务员副处级（实际执行比副处级低一些），而我们单位是正科级机关，设置的正科级领导只有三个。
分别是党委书记，乡长和人大主席，这三个人拿的是正科级工资，是所有公务员人群中工资最高的，但是副高级职称的三个事业身份人员，拿的工资却是副处级的，比单位的三个最高领导还高几百块。
但是同级别的事业身份人员工资是比公务员低的，比如财政分局的局长是事业副科级（管理岗八级），而副乡长是公务员副科级，两个人其实级别是一样的，都是乡党委委员，副科级领导，地位一样，但是事业副科级的工资比公务员副科级低500左右。
所以不管是公务员还是事业单位，其实工资高低不是肯定的，毕竟公务员和事业单位实行不一样的工资体系，各有各的优势，表面公务员能够拿车补和话补貌似比事业单位更划算。
但是很多公务员到正科级就基本上止步了，而事业单位技术岗可以通过评定职称来提高收入，大多数人45岁以前就能够评上副高级职称，拿到副处级工资，这点事业编制人员比公务员更有优势
大家可以在进入体制内之后，提升自己的工资水平和职位水平，更能够在行业里变得更加有耐心，等你在体制内工作多年后。
其实就可以进一步地悟出背后的逻辑和原理，让你成为真正的高人，所以大多数员工都愿意把这份工作当成一辈子都要去从事的，岗位稳定有保障，对于他们而言可能就是最好的方向。