美他环素可能引发一系列不良反应，首当其冲的是消化系统问题。患者可能会经历恶心、呕吐、上腹不适、腹胀或腹泻，甚至罕见的胰腺炎，尤其是在服药后立即躺下的情况下，可能还会有食管炎和食管溃疡的风险。
肝脏方面，美他环素可能导致脂肪肝，特别是对于妊娠期妇女、肾功能受损的患者，风险较高。同时，它也可能引发胰腺炎，但患者通常没有原发的肝病。过敏反应也是值得注意的问题，常见的症状有斑丘疹和红斑，罕见的严重反应包括荨麻疹、血管神经性水肿、过敏性紫癜、心包炎，以及系统性红斑狼疮病情加重。此外，日晒时可能出现光敏现象，因此建议避免直接暴露于阳光下，一旦皮肤出现红斑应立即停药。
血液系统方面，极少数情况下，美他环素可能引起溶血性贫血、血小板减少、中性粒细胞或嗜酸粒细胞减少。中枢神经系统方面，良性颅内压增高是个潜在风险，表现为头痛、呕吐、视神经乳头水肿等。
在肾功能受损的患者中，长期使用美他环素可能导致氮质血症、高磷酸血症和酸中毒。另外，长期服用本品可能诱导耐药菌株的产生，如金葡菌、革兰阴性杆菌和真菌，严重的可能导致败血症。此外，美他环素可能影响人体的正常菌群平衡，导致维生素缺乏，引发口干、咽炎、口角炎和舌炎等口腔问题。
美他环素又称盐酸美他环素，别名甲烯土霉素。属于四环素类抗生素，对多数革兰阳性菌、革兰阴性菌、立克次体、支原体、衣原体、放线菌及沙眼病毒等均有抑制作用，抗菌活力较四环素强。