1、商丘工学院
商丘工学院是一所普通本科高校。学校现占地76.67公顷，校舍建筑面积30.823万㎡，校内实验室、实训车间120个，校外实习、实训基地128个，图书馆馆藏纸质图书106.7万余册。学校设有机械工程学院、土木工程学院、护理学院、传媒与现代艺术学院、管理学院、信息与电子工程学院、继续教育学院、思想政治理论教学部、体育教学部、基础教学部10个教学单位。全日制在校生12992人。
2、商丘学院
商丘学院（原河南农业大学华豫学院）是经国家教育部批准的全日制民办普通本科院校。目前占地面积2017亩，全日制在校生2万人，现总资产超13亿元，建筑面积45万平方米。校园环境优雅大气，教学区、行政区、生活区、运动区、休闲区错落有致、布局合理。
3、商丘师范学院
商丘师范学院坐落于国家级历史文化名城、三商之源、华商之都——河南省商丘市。学校现有平原路、文化路两个校区，占地面积2000余亩，建筑面积近60万平方米。现有普通全日制在校生25000余人。学校教学设施完备，建有现代化的实验室、语音室、多媒体教室、微格教室、演播厅和体育场馆。图书馆馆藏丰富，馆藏纸质图书170万册，电子资源数据库17个。
4、商丘职业技术学院
商丘职业技术学院是经河南省人民政府批准、教育部备案的一所全日制综合性公办高等职业院校。学院占地1743亩，建筑面积57万平方米，固定资产总值6.67亿元，图书馆藏书143万册，中外文纸质、电子期刊8000种。学院有16个教学系，开设有61个专业。
5、商丘医学高等专科学校
商丘医学高等专科学校，坐落在中国历史文化名城、全国优秀旅游城市——商丘古城湖畔，是一所全日制公办普通医学高等专科学校。学校前身是始建于1921年的“归德圣保罗医院护士学校”，是河南省开办医学专业最早的几所学校之一。[1] 2015年入选国家首批现代学徒制试点单位。
6、永城职业学院
永城职业学院创办于1956年，地处豫、鲁、苏、皖接壤处的河南省永城市东城区，是经河南省政府批准、国家教育部备案的公办全日制高等专科学校，是“河南省骨干高职院校建设项目”、“河南省职业教育特色院校建设计划”和“河南省职业教育品牌示范院校”立项建设学校，学院先后被授予“河南省文明学校”、“河南省普通大中专毕业生就业工作先进集体”、“河南省园林单位”等称号。
本科
1、商丘师范学院，商丘师范学院（Shangqiu Normal University）坐落于河南省商丘市，为公办全日制普通高等学校，入选教育部数据中国“百校工程”产教融合创新项目。
2、商丘学院，商丘学院（Shangqiu University）是经国家教育部批准的全日制普通本科院校。学院筹建于2002年，2005年7月被教育部批准设立成名为河南农业大学华豫学院的独立学院，2011年4月教育部同意河南农业大学华豫学院转设为商丘学院。
3、商丘工学院，商丘工学院（Shangqiu Institute of Technology）位于河南省商丘市，是经国家教育部批准的民办普通本科高校。名誉校长李肇星。
4、河南大学护理学院商丘分院，河南大学医学院成立于2001年3月，其前身是开封医学高等专科学校。建院以来，医学人秉承百年河大精神，牢记“明德新民、止于至善”的校训，历经十年躬耕孕育，今已破土萌芽。
专科
1、商丘职业技术学院，商丘职业技术学院（Shangqiu Polytecnic）是经河南省人民政府批准、教育部备案的一所公办全日制高等职业院校，全国示范性高等职业院校。
2、商丘广播电视大学，商丘广播电视大学（简称商丘电大）始创于1982年2月，当时名称为河南广播电视大学商丘地区工作站，行政上隶属于商丘地区教育局。
3、商丘医学高等专科学校，商丘医学高等专科学校，坐落在中国历史文化名城、全国优秀旅游城市——商丘古城湖畔，是一所全日制公办普通医学高等专科学校。学校前身是始建于1921年的“归德圣保罗医院护士学校”，是河南省开办医学专业最早的几所学校之一。
4、永城职业学院，永城职业学院创办于1956年，地处豫、鲁、苏、皖接壤处的河南省永城市东城区，是经河南省政府批准、国家教育部备案的公办全日制高等专科学校。
5、商丘幼儿师范学校，商丘幼儿师范学校位于归德南路与华商大道交叉口向北500米路西，商丘幼师是1999年7月经河南省人民政府批准、在原夏邑师范学校的基础上改制而成的公办中专学校，是河南省首批改制的三所幼师之一。
二类本科院校：商丘师范学院
三类本科院校：河南农业大学华豫学院（分校）
医学类专科学校：商丘医学高等专科学校
大专学院：商丘职业技术学院
商丘科技职业学院
商丘财经学院