原核生物启动子:
在基因或
操纵子的终末往往具有特殊的终止顺序,它可使转录终止和
RNA聚合酶从DNA链上脱落.
例如大肠杆菌色氨酸操纵子后尾含有40bp的GC丰富区,其后紧跟AT丰富区,这就是转录
终止子的结构.\x0d终止子有强、弱之分,强终止子含有反向重复顺序,可形成茎环结构,其后面为polyT结构,这样的终止子无需终止蛋白参与即可以使转录终止.
而弱终止子尽管也有反向重复序列,但无polyT结构,需要有终止蛋白参与才能使转录终止.\x0d典型转录终止子的特征:茎环结构,富含GC;含4个以上的U.
原核生物启动子序列包括:
CAP序列,增强聚合酶的结合和转录的起始序列(-70~-40);
识别区(-35);
解旋区(-10);
转录起始位(+1)
真核生物启动子:
启动子(promoter):
真核基因启动子是在基因转录起始位点(+ 1)及其5’
上游近端大约100~200bp以内(或下游100bp)的一组具有独立功能的DNA序列,每个元件长度约为7~20bp,是决定RNA聚合酶转录起始和转录频率的关键元件.
启动子包括:
A.核心启动子(core promoter):
是指足以使RNA聚合酶Ⅱ转录正常起始所必需的、最少的DNA序列.其中包括转录起始位点或起始子(initiator)(+1):
一般是A或G及转录起始位点上游-25/-30bp处富含TA的典型元件TATA框.
.上游启动子元件(upstream promoter element,UPE):
包括通常-70bp附近的CAAT框:GGCCAATCT和GC框:GGGCGG等,能通过TFⅡ-D复合物调节转录起始的频率,提高转录效率.