哈尔滨工程大学中最好的就业系是其工程类专业。具体专业和就业情况如下：
哈尔滨工程大学作为我国一所知名的工科高校，其工程类专业一直以来都是热门且就业前景广阔。特别是以下几个系：
一、船舶与海洋工程专业
该专业在国内外船舶制造、海洋资源开发等领域具有很高的声誉。随着全球海洋经济的发展，该专业毕业生在船舶设计、制造、管理以及海洋资源开发等领域有着广泛的就业机会。
二、计算机科学与技术专业
随着信息技术的飞速发展，计算机领域一直处于热门行业。哈尔滨工程大学的计算机科学与技术专业培养了大批高素质的人才，毕业生在软件开发、网络安全、系统集成等方面有很大的发展空间和就业前景。
三;机械工程专业
机械工程专业是哈尔滨工程大学的传统优势专业之一。毕业生在机械设计、智能制造、工业机器人等领域有着广泛的就业机会，且由于该专业人才需求量大，毕业生就业形势一直很好。
综上所述，哈尔滨工程大学的工程类专业整体就业情况较好。当然，具体选择哪个专业还需要根据个人的兴趣、特长以及未来的职业规划进行综合考虑。