二郎神烧毁花果山，没有受任何人的指示。不肯受天庭招降的孙悟空，在当时只能算是个妖猴。妖猴孙悟空被捉拿后，他的花果山自然被二郎神当做妖精洞一把火烧了。
在护送唐三藏去西天的路上，“火烧妖精洞”这一招，是悟空和他的师弟悟能、悟净三人惯用的手段。
《西游记》十八回，行者放火烧了黑风洞，原文描写如下：
行者一发行凶，将他那几层门上，都积了干柴，前前后后，一齐发火，把个黑风洞烧做个红风洞，却拿了袈裟，驾祥光，转回直北。
《西游记》五十五回，悟空等人烧了琵琶洞，原文描写如下：
（师兄弟三人）又寻些素米、素面，安排了饮食，吃了一顿。把那些摄将来的女子赶下山，指与回家之路。点上一把火，把几间房宇，烧毁罄尽，请唐僧上马，找寻大路西行。
《西游记》六十一回，八戒烧了摩云洞，原文描写如下：
行者见了，问曰：“那摩云洞事体如何？”八戒笑道：“那老牛的娘子，被我一钯筑死，剥开衣看，原来是个玉面狸精。那伙群妖，俱是些驴、骡、犊、特、獾、狐、狢、獐、羊、虎、麋、鹿等类。已此尽皆剿戮，又将他洞府房廊放火烧了”
《西游记》七十二回，行者和八戒烧了盘丝洞，原文描写如下：
八戒道：“你们扶师父走着，等老猪一顿钯筑倒他这房子，教他来时没处安身。”行者笑道：“筑还费力，不若寻些柴来，与他个断根罢。”好呆子，寻了些朽松、破竹、干柳、枯藤，点上一把火，烘烘的都烧得干净。
《西游记》七十九回，行者和八戒火烧了清华洞，原文描写如下：
行者叫：“八戒，不必筑树。但得此物填塞洞里，放起火来，烧得个干净。”火一起，果然把一座清华妖怪宅，烧作火池坑。
《西游记》八十六回，行者和八戒火烧了连环洞，原文描写如下：
行者道：“打又费工夫了，不若寻些柴，教他断根罢。”……行者点上火，八戒两耳搧起风。那大圣将身跳上，抖一抖，收了瞌睡虫的毫毛。那些小妖及醒来，烟火齐着。可怜！莫想有半个得命。连洞府烧得精空，却回见师父。
在《西游记》六十六回，师徒们临行前，放火烧了小雷音寺。七十三回行者又烧了黄花观。八十九回，沙僧和八戒火烧了虎口洞。九十回，八戒又放火烧了九曲盘桓洞。九十二回八戒和沙僧又放火烧了玄英洞。
综合以上可知，放火烧妖精洞府，是斩妖除魔惯用的手段，所以在捉拿了妖猴孙悟空后，二郎神放火烧了花果山，为的是把孙悟空的猴子猴孙斩草除根。