病圃应设定在地势平坦土质与土壤肥力均匀排灌方便的田块内，四周应无高大建筑物或树木土传病害受土壤差异影响更大，对试验地要求更为严格，应多次耕耙匀地，接菌量务求均匀
试验小区的大小形状种植方式排列方式需按试验材料种类和试验目的酌定总的要求是要有足够的重复次数，设标准感病品种和抗病品种对照，以利于试验资料的统计分析病圃周围设保护行对气传病害，比较品种或品系的定量抗病性时，小区面积不应过小，小区间应有足够的间隔或种植隔离植物，以减少菌源交流造成的小区间干扰不同的病害，小区间干扰的程度不同，鉴定前应有所了解，以便合理调整小区面积和采取有效隔离措施
麦类抗锈性鉴定时，在每一排或两排试验区之间与株行垂直的方向设一诱发行，诱发行种植对目标病害高度感染对其他病害高度抵抗的品种，先接种诱发行，发病产孢后，均匀地侵染试验区
以小麦抗锈育种为例，原始材料圃材料数目多，小区一般2~4行，顺序排列，每隔10行种植对照品种1次，接种混合菌种但重要原始材料或亲本需分小种鉴定同一套材料分设多个小种圃，各圃只接种1个小种，试验材料条播或穴播，穴播时每穴10~20株，全面喷雾接种或只接种诱发行
杂种圃或选种圃均单独种植，小区按组合及系统顺序排列，不设重复，以亲本为对照，接种混合小种，选择优良抗病单株
品系预备试验以比较产量等农艺性状为主，需要时可在病圃中鉴定，设置标准抗病和感病品种对照小区面积10m2左右，尽量设置重复，采用间比法或互比法排列，接种多个小种混合菌种或进行自然发病鉴定
品种比较试验时入选品种一般不超过15个，小区面积酌情加大，随机区组法设计，重复不少于3次，设感病和抗病品种对照，接种混合菌种或单个流行小种，或进行自然发病鉴定
当需要调查某些特定的定量流行学指标来评定抗病性时，对试验设计常有特殊的规定例如，测定病害流行曲线下面积或流行速度以评定慢锈性时，小区需方形(方块圃)点播，在小区中心接菌，发病后自然传播，系统调查发病情况测定耐锈性时，供试品种需分设接种区和喷药防治区