目前可人工栽培的食用菌约90余种，已进行较大规模商业化栽培的有20余种，小规模区域性栽培的珍稀菇类也有十几种。那么应该选择哪些品种才能获得理想的效益呢？简单地说，要根据市场和生产条件来选择。
（1）市场调查与分析
生产出的产品只有符合市场需求，才能获得理想的效益。不同的栽培规模、生产模式与市场预定位，要求调查的范围和深度也不同。一般说来，栽培规模较大的生产基地、企业或较大规模的推广计划，需做较大范围和较深入、细致的市场调查；较小规模的家庭式生产，调查范围及详细程度要小得多。市场调查主要有：
①当地市场调查 这是一项基础性的工作。包括对当地市场已有的菇种、销售数量、产品形式、消费趋势、现有市售品的资源状况与价格等。通过调查分析，对市场容量及近期价格变化做出基本估计。如果栽培地距大中城市较远，交通运输不便，产品几乎完全就地销售，则对当地市场的调查就更为重要。
②国内市场的调查 对于规模较大的生产基地、企业或推广项目，这项调查是必需的。要想驾驭市场，必须进行详尽的市场调查与分析，这包括全国各地的分类产量、加工方式与流通规律；本省、市、县的栽培品种、产量、上市规律和销量、价格情况；预定销售市场的人群对菇类产品的具体要求及消费规律等。
③国外市场的调查 将产品市场预定位于出口的企业，必须进行此项调查。这主要通过外贸部门、海关和多年从事出口的企业。调查内容有菇种、数量、价格、加工要求、产品规格、质量要求、包装方式、进口国的消费习惯和进口商的信誉等。
（2）生产条件调查
经过以上的市场调查与分析，你也许会对你所要栽培的食用菌种类有一个大体把握，也就是说你已选择好了几种市场行情不错的品种，在此基础上，你还需要根据当地的生产原料、气象条件及市场情况进行进一步的筛选，最终科学地确立你所要投入生产的品种。
①生产原料 主要是构成培养基的各种原料、栽培场所和一些辅助材料。各地要根据各自的资源条件来选择栽培种类，有些辅助材料在没有形成产业的地方较难购到，应事先联系。栽培原料应尽量就地取材，发挥资源优势，降低生产成本，使产品在市场上占据竞争优势。
②气象条件 当地的气候、气象条件及变化规律能否适宜拟选用品种的生长需求，是栽培能否成功的关键。适宜的气候条件与科学的菇事安排，可大大减少为食用菌正常生长而人为创造条件所需要的成本，而且产量高、品质佳。
③市场距离 在距大中城市较近的地区，以发展适于鲜销的品种为主；而距大中城市较远、鲜销数量有限的偏僻乡村或山区，则应以适于干制、腌制等宜加工的菇种为主。在签订收购合同的前提下，适于罐头等加工的菇种也可栽培。
在对上述主要条件和因素进行调查分析后，菇农便可以明确应该选择哪些种类去发展了。