一、养殖业发展过程中的环境保护现状及存在污染问题
目前，规模化畜禽养殖场（户）对环境造成污染主要有以下三个方面：
（一）粪便污染。据试验资料分析和初步测算：每头猪每天大约产生5.5L排泄物（不包括冲洗圈舍的废水），每年大约排泄9.53kg的氮。而一个万头猪场(按中猪计)每年至少向猪场周围排放1.26万吨的粪便。一个万头规模化养猪场，常年存栏量约为6000头，每天排放粪尿量约29吨，全年约为10585吨。由于猪对饲料中氮的吸收率很低，大量的氮随粪便被排在土壤中累积后，超过了其单位面积生态环境再循环需求，而且通过雨水的冲刷也会造成地下水源和地表水源的污染。
（二）污水污染。由于部分规模畜禽养殖企业（户）环保意识较差，对粪便污水管理落后，致使大量的粪便随冲洗水直接流失，甚至有的将粪便直接排入河流中，严重污染了大江大河的水质。而规模猪场（户）排放的粪尿污水中的生化指标极高，其中COD(化学耗氧量)和BOD(生物耗氧量)远远超过国标。高浓度的有机污水排入江河湖泊中，会造成水质不断恶化，藻类过度生长，从而导致鱼类的大量死亡，威胁水产业的发展。况且畜禽粪便污染物不仅污染了地表水，使地表水中的硝酸盐含量超出允许范围(50mg/L)，其有毒、有害成分还易进入到地下水中。一旦污染了地下水，将极难治理恢复，造成较持久性的污染。
（三）恶臭及氨污染。由于相当部分的规模化畜禽养殖场（户）对粪便没有进行有效处理，其散发出非常难闻的气味，严重地污染了周围居民的生活环境。大量研究表明，环境氨气浓度过高会影响动物生产性能和健康状况，动物采食量和日增重下降，肺炎发生率上升，性成熟推迟。
二、加强对规模化养殖场(户)管理的办法和综合防治措施
随着经济的快速发展，人们环保意识的增强，进行污染物的减量化、无害化、资源化处理与合理利用，很有必要进入到法制化管理的重要阶段。据全国第二次农业普查资料：2006年，分布在玉林市7个县（市、区）、主营畜牧业的法人单位已达178家；年存栏50头及以上的生猪规模经营户有7845户，年存栏2000羽及以上的养鸡规模经营户有6663户。因此，为让全市畜禽养殖业自身得到科学的、可持续的发展，加强对禽畜规模化养殖业排泄物污染的治理已迫在眉睫。
（一）高度重视规模化养殖场(户)对环境造成的污染。调整规模化养殖场(户)的布局，培植公司+基地的养殖场(户)生产模式，规模化养殖场(户)改模式为：公司统一管理，各小规模养殖场(户)分散于各村落，使养殖场(户)产生的粪便能够及时有效地就地消化，既做到变废为宝，又将养殖场(户)排泄物造成的环境污染降至最低。吸取国外畜牧业发展过程中存在的先污染后治理的教训，建议政府部门要高度重视，将畜禽污染的管理纳入环境管理工作的主要内容，各级地方政府也要加强本地区畜禽污染的管理工作。
（二）加强畜禽环境污染的法律、法规建设及执法力度。加强对规模化畜禽养殖场（户）的选址、污水排放、粪便处理的管理；对新建规模化养殖场(户)需有建场许可证及粪便废弃物处置的申报等。最重要的是要加强已有法律、法规的执法力度及监督力度，保障其顺利实施。在实际工作中，对逾期未完成限期治理任务，具体采取何种措施，由环境管理机关视具体情况确定，如果由于治理者所采取的治理方法不当，治理后污染有明显减轻但仍不能达到标准要求，环境管理机关可予以警告和惩处，同时给予其一定的时间整改，而不是简单地关停了事；在完成治理任务前不得建设扩大生产规模的项目，限期治理项目的确定要依据排污总量控制计划指标。
（三）加强畜牧业污染的宣传教育，做到信息公开与公众参与。要大力宣传畜禽污染的严重性，通过开展畜禽污染现状的调查，加强人们对规模化养殖场（户）造成环境污染严重性的认识，提高畜禽养殖场（户）从业人员的环境意识和管理水平，引导畜禽养殖场（户）走农牧结合的道路。必要时可在媒体上公布畜牧养殖场（户）排污达标情况，实行舆论监督与公众参与，防止任意排污现象的发生。
（四）采用综合管理措施。由于环保投入经费有限，过分依赖末端治理，在环保监督跟不上或有机可乘时，运行过程容易产生偷工减料，因此，必须考虑采用综合治理措施，即从多环节入手，加强生产工艺的改进和源头的管理。从长远来看，解决养殖场(户)废水污染问题需要依赖综合措施，例如，调整饲养规模、合理选点规划、配套相应土地、提高饲料利用率、改善冲洗办法和加强废弃物管理等。如果能从正反两方面对现有养殖场(户)上述各环节措施的环境效益进行分析和评价，必然有助于引导、发展或制订经济与环境和谐发展的养殖业。
（五）利用区域或养分平衡措施。在动物生产过程中，动物排泄总是必然的。任何地区的环境容量都有限，需根据当地的环境容量来确定养殖规模、布局与生产方式，以及废弃物的消纳措施。在欧美国家的规模化养殖业中，已开始改变过去只重视废弃物末端处理的做法，而现在从政策法规上，是根据养殖项目的养分排泄量（主要是氮和磷）、当地的环境容量以及利用养分的配套设施来审核养殖规模。国内已经有些地方开始启用类似的条例。有必要综合分析和总结国内外的经验和资料，提出适度养殖规模下，养殖场(户)粪便、废水的排泄量及其养分含量、养分损失，以及待处理或消纳的养分量，初步提出合理的废水处理工艺、一定面积的配套土地及其土地利用方式。
（六）考虑环保治理措施。由于禽畜养殖业作为本市助农增收的一大行业，因此，发展养殖业和治理环境并举，做好养殖业废弃物的末端治理必不可少。经过多年的发展，一些大中型养殖场投资建设了废水处理设施，但有的运行不善。有必要对现有养殖场(户)废水处理设施的建设、工艺和运行现状做出评估，主要从技术和经济角度总结出能正常运转的工艺模式、管理经验、投资与运行费成本，及不能正常运转的原因。需要针对各县（市、区）的实际情况，例如生产工艺、人工、农业运作模式、环保政策、环境管理、行业管理、养猪市场、肥料政策等综合考虑，评价、寻找合适的工艺和管理办法。
（七）完善政策与管理措施。尽管过去30多年，市政府在畜牧业环保方面做了大量工作，包括科研、技术示范、政策法规和管理等，并取得了长足进步和诸多成果，但与发达国家比较，仍然需要继续完善相关政策和加强管理。近几年，全市在畜禽卫生防疫措施、品种改良与品种保护、生态示范县建设、畜产品安全、兽药使用、农村沼气工程等方面采取了许多新举措，并取得良好效果；但与养猪环保直接相关的除环保法规外，其他支持性政策或条例少，或者执行力度不够。例如政府或非政府组织的培训计划、鼓励使用畜禽粪便生产和使用有机肥、有利于防疫和生态环境保护的养猪场科学合理选点规划布局规范、严格的建场审批制度、严格的监督程序等。今后需要改变以往在养殖业环保上侧重惩罚性管制，而是要加强源头建设性引导与管理，这样也可以减轻监管的强度。根据地区环境容量，探讨规模化养殖业的适度规模与布局、经营与组织办法、废弃物处理与利用技术三项配套措施。上述欠缺的根源主要还是对加强环境保护的意识有局限性，或者因人力与资金不足，资源有限，引起条例及监督力度不够。也反映急需培养一大批该领域的人才，壮大研究、推广和管理队伍，以满足发展需要。
（八）加强以厌氧发酵（沼气）为主体的废弃物处理与综合利用技术研究。养猪废水处理的单项技术以及多项技术组合的工艺，已从“八五”开始着手研究与示范，“九五”、“十五”期间在面上和深度上都得到很大程度地加强，例如“三段式”的工艺，并在示范点取得良好效果，取得了许多参数和积累了丰富的系统管理经验。但推广力度不够，难度也大。这也是与国外畜牧业环保的主要差别之一。为了应对这些情况，从技术研究的角度看，仍然十分需要技术与经济可行、并更加成熟可靠的猪废水处理与利用的新型模式（系统）。尽管“固液分离—酸化水解—氧化塘”也已被许多猪场用于处理废水，并能应对当前养猪环保的压力，但从达标排放、安全无害化以及能源发展考虑大中小型猪场以厌氧发酵（沼气）为主体的废弃物综合开发利用具有更大的发展前景，如下三个问题的突破，将有助于该模式的推广应用：低温环境下的池体保温技术研究与示范，以确保稳定远行，解决冬季沼气供求矛盾；服务养殖生产的沼气利用技术研究与示范，增加沼气利用渠道，提高沼气效益，减少高温季节沼气的空中排放问题；沼液深度处理（N/P）与利用技术研究与示范，积极探索配套的大棚种植以及水培系统。
利用规模化畜禽场粪便，经过一定的加工、处理，可以生产出适合蔬菜等经济作物生长需要的有机-无机复混肥。该项技术开创了一条以开发利用废弃物质资源、促进环境治理的新路，将畜禽场的环境治理与畜禽粪便的开发利用紧密结合，使畜禽场处于一种良性循环的状态，同时又生产出了有利于农作物生长的有机-无机肥料，这对于促进本市畜牧业规模化发展的良性循环具有重要的意义；超大集团则利用畜禽的排泄物为原料，利用简易的生物处理方式制成级有机载体，配之以功能强的活性微生物菌种，生产出肥效显著的超大生物有机肥料，找到了一条适合处理畜禽粪便的处理方式，可在全市大面积推广使用。