中国共产主义青年团的组织机构包括多个部门，以支持其全面的工作职能。中央机关的核心部分是中央书记处，下设多个办公室，如书记处办公室、秘书处、综合处等，负责日常管理和协调工作。
组织部负责干部管理，包括干部一处、二处、组织处和教育处等，关注青年干部的培养和发展。宣传部则关注思想教育、新闻传播、理论宣传和文体活动，通过网络宣传加强青年思想引领。城市和农村青年工作部分别处理城市和农村青年事务，如社区和农村青年中心的建设指导。
学校部关注大学、中学教育，以及全国学联的管理工作，而少年部则负责青少年的宣传教育和组织培训。统战部涉及青联、社团、民族宗教、港澳、台湾及海外学人工作。维护青少年权益部则保障青少年的合法权益，法制工作处和维权工作处是其中的重要组成部分。
国际联络部负责对外交往和交流，机关党委则管理党内事务。此外，还有团中央青年志愿者行动指导中心、实业发展中心以及一系列教育、出版、基金会、研究机构，如中国青年政治学院、中国青少年研究中心等，以及负责媒体工作的中国青年报社和出版机构。
地方组织部分列举了各省级委员会，如北京市、天津市等，以及中国共产主义青年团在国家机关、铁道、民航、金融和企业等领域的专门委员会。这些机构共同构成中国共产主义青年团的坚实组织网络，致力于服务青少年的成长和发展。
中国共产主义青年团（简称共青团）是中国共产党领导的先进青年的群众组织，是广大青年在实践中学习中国特色社会主义和共产主义的学校，是中国共产党联系青年群众的桥梁和纽带，是中华人民共和国的重要社会支柱之一，也是中国共产党的助手和后备军。