香港和澳门肯定是不同的签注，如果两个地方都要去，就都需要申请。
你现在如果想去香港，就要本人，去户口所在地的出入境管理处拿着身份证和户口本去办理签注（这是自由行的材料，如果你是团队游，除了以上材料还要准备旅游社出具的发票）。如果还要去澳门，就要看看上次的签注过期没有，签注页面上有有效日期。再就是旧的签注有没有用过，如果你上次办理的是澳门单次的，而你用这个签去了一次澳门，那也要重新办理。
追问是不是香港和澳门的通行证要分开的？
追答是在一个本子上，签注是分开贴在不同的页面上的，所以你再办理香港 或者澳门签注的时候，要拿着你那本来往港澳通行证 去办理，申请成功以后，出入境部门会贴一张新的签注在那个本本上