最主要区别是舰载机出动。效率，先进在甲板布局、电磁弹射器、电磁拦阻索、全寿命反应堆及升降机部分等方面。
一、舰载机出动效率区别介绍：
最主要区别是舰载机出动效率，这也是评价一艘航母强大与否的根本标准。尼米兹级的舰载机出动能力为每天出动140-160架次
而美国海军对于福特号的要求是在此基础上至少提高15%，也就是达到180架次，在高强度的情况下，甚至要超过220架次。同时配合各种精确制导弹药使用，如JDAM、JSOW等，福特级航母的舰载机联队一天能打击的目标数量由现在的700个增加到1200个。
二、进步和革新介绍：
1、甲板布局
（1）福特级
福特级与尼米兹级相较，在飞行甲板布局方面最主要的改良是油料与弹药补给的动线。后期型尼米兹级拥有三具甲板弹药升降机，分别位于前方弹射器中央、右舷两座靠前方的飞机升降机之间，以及舰岛旁边；
进行弹药补给作业时，舰上人员必须先透过弹舱升降机，将武器从水线以下的弹药库（分置于数层舰底甲板）往上送至03甲板（即下甲板机库的再下一层），然后借用位于03甲板的舰上餐厅餐厅空间，在餐桌上完成武器的组装设定，接着透过输送车将弹药运至甲板弹药升降机部位，才能送上飞行甲板。
（2）尼米兹级
尼米兹级将甲板弹药升降机设在飞行甲板中间是因为配合弹药库的位置，这使得在透过弹药升降机将武器送上甲板时，所有的飞行起降作业都必须暂停。
此外，武器送上甲板后，还需透过甲板运输车个别地送到每一架需要挂弹的飞机位置；相似地，飞机的加油作业也是透过穿梭在甲板各处的加油车直接开到需要补给的飞机旁进行。总而言之，每次尼米兹级的机队进行加油挂弹作业，总共需耗费2小时左右。
2、电磁拦阻装置
福特级使用了的电磁拦阻装置（AAG）， 尼米兹级的MK-7液压拦阻装置与电磁拦阻装置相比，制动力过载情况无法相提并论。采取了电磁拦阻装置，不仅在战机着舰过程中更平稳，人员和战机受到的过载伤害较少。更重要的是拦阻不同种战机时转换方便。
3、新型升降机
尼米兹级的升降机是采取液压机构及空气能储能系统。而福特级则是直接利用永磁电机直接驱动，与我们普通电梯在原理上相近。也是采取变频控制技术。
福特级的升降机平台重量比尼米兹级有所减轻，而且整个系统也有对重部分。从外表看，福特级是等腰梯形，而尼米兹是直角梯形。由于直解梯形中直解一边对中机库出入口，因此在战机调备灵活性上远不及福特级的方便。
参考资料来源：百度百科-尼米兹级航空母舰
参考资料来源：百度百科-福特级航空母舰