根据国务院（国发〔1999〕26号）《国务院关于进一步调整国务院部门（单位）所属学校管理体制和布局结构的决定》，国防科工委继续管理其所属学校。2008年3月15日第十一届全国人民代表大会第一次会议通过的《关于国务院机构改革的决定》，不再保留“国防科学技术工业委员会”的机构设置，国防科工委直属的7所高校也相应转由中华人民共和国工业和信息化部直属管理，分别是：西北工业大学、哈尔滨工业大学、哈尔滨工程大学、北京航空航天大学、北京理工大学、南京航空航天大学、南京理工大学。
中华人民共和国中央部门（单位）直属高等学校[1]，简称[2]“中央部属高校”，是指国务院组成部门及其直属机构在全国范围内直属管理一批高等院校，目的是在探索改革上先走一步，在提高教学、科研和服务社会方面发挥示范作用，我国高校分为：中央部属高校和地方省属高校，经过全国高校管理体制的调整，将实力较强、学科特色鲜明的高校划归教育部直属管理[3]（72所教育部直属高校，为同一所高校：中国地质大学（北京 武汉）、中国矿业大学（北京 徐州）、中国石油大学（北京 华东））。中国2600多所高校[4]，中央部门直属管理111所，其余2500多所管理权限在地方。
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