（1）有机肥料含有大量的有机质，具有明显的改土培肥作用；化学肥料只能提供作物无机养分，长期施用会对土壤造成不良影响。
（2）有机肥料含有多种养分，所含养分全面平衡；化学肥料所含养分种类单一，长期施用容易造成土壤和食品中的养分不平衡。
（3）有机肥料养分含量低，需要大量施用；化学肥料养分含量高，施用量少。
（4）有机肥料肥效时间长；化学肥料肥效短而猛，容易造成养分流失，污染环境。
（5）有机肥料来源于自然，肥料中没有任何化学合成物质，长期施用可以改善农产品品质；化学肥料属纯化学合成物质，施用不当会降低农产品品质。
（6）有机肥料在生产加工过程中，只要经过充分的腐熟处理，施用后便可提高作物的抗旱、抗病、抗虫能力，减少农药的使用量；长期施用化肥，由于降低了植物的免疫力，往往需要大量的化学农药维持作物生长，容易造成食品中有害物质增加。
（7）有机肥料中含有大量的有益微生物，可以促进土壤中的生物转化过程，有利于土壤肥力的不断提高；长期大量施用化学肥料可抑制土壤微生物的活动，导致土壤的自动调节能力下降。
详情有机肥料和化肥的区别
有机肥拥有丰富的营养成分
有机肥增加土壤中的有机碳，对土壤肥力至关重要
有机肥改善土壤结构
有机肥改善通气，促进更好的根系建立和植物生长
有机肥改善水渗透
有机肥改善土壤排水
有机肥提高保肥/保水能力
化肥速效，肥效快
化肥容易烧根
化肥长期使用会破坏土壤结构
化肥会影响土壤生态圈
肥料的来源很多。综合性化学合成肥料来源于矿物，就是所谓的无机物合成而来。有机肥料来源的肥料是微生物、有机废弃物和其他类似材料等自然资源中。
化肥是什么
化学肥料以其速效性和以液体、颗粒、等多种形式而出现。化学肥料是水溶性的，植物可以立即汲取养分。虽然这提供了一个快速的养分，但是不会持续。
化学肥料能迅速促进植物生长，但对改善土壤质地、提高土壤长期肥力几乎没有什么作用。他们是高度水溶性的，可以渗透到水中。这是化学肥料的快速结果代价的；用太多，会灼伤你的草坪和植物。
有机肥料的来源是什么
有机肥来源的肥料对植物和土壤都有好处，如果使用得当，一般不会燃烧或损坏植物。有机肥料刺激土壤微生物繁殖，改善土壤结构。土壤微生物在将有机肥料转化为可被植物吸收的可溶性养分方面起着重要作用。有机肥料通常提供次生和微量营养素的需要，通常在化学肥料中却没有。
有机肥料氮、磷、钾的来源比化学肥料相对较低，但是可以保持土壤肥力更持久一些。因此，有机肥对植物的影响通常是更微妙的。假如有机肥应用到草坪，它可能需要一段时间才能看到结果，但回报是草坪保持绿色的时间。
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