因为瓜皮含有苦味素
常见甜瓜也称香瓜是生活中常见的水果，但是有的瓜不但不甜反而苦，这是因为这个瓜含有苦味素，在瓜的生长过程中，全靠瓜蒂来输送最后一道营养物质供应瓜的生长。
但是植物含有苦味素，如果含量比较高就会影响到瓜的口感，含量正常瓜不存在苦味，如果含量过高，瓜皮甚至瓜瓤都会很苦。
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研究者通过研究黄瓜发现：黄瓜苦味正是由三萜化合物葫芦素C导致的，葫芦素是一类高度氧化的四环三萜化合物，仅在葫芦科植物中（黄瓜、西瓜和甜瓜等）发现，苦是这类化合物最显著的特点，因此，葫芦素也叫苦味素。极低量的葫芦素（0.1 mg/L）就能引起明显的苦味，比典型的苦味剂咖啡因还要苦100倍左右。
苦味素的发现对黄瓜育种和抗肿瘤药物开发具有重大的意义。植物的生长面对各种外界生物胁迫和非生物胁迫，极苦的苦味素是最佳的防御武器，可用来抵御病虫害的侵入。
因此苦味素是保护植物的 绿色农药。科学家通过黄瓜功能基因组研究和代谢组学研究发现，可以通过控制黄瓜叶片和果实中苦味素差异积累，培育出叶苦果实不苦的超级优良黄瓜品种。
在印度，极苦的野生黄瓜果实和叶片除了被用作泻药，还被用于治疗各种炎症。现代医学研究发现，甜瓜瓜蒂中的苦味素被提取出来并开发成治疗肝病的有效药物。
近年来新发现的苦味素药用价值引起了人们的关注，苦味素对于肿瘤的治疗具有非常好效果。由于黄瓜中苦味素含量极低，因此通过解析苦味素代谢通路和合成生物学技术，提高苦味素的含量对于产业化苦味素应用于临床肿瘤治疗具有非常重大的医学意义。
参考资料来源：百度百科——苦味素
甜瓜皮苦是一个遗传性状，性状在天气不好的时候尤其是高温干旱是表现尤为明显，不要吃皮就是，很多葫芦科的作物（瓜类）都有这种特点，像黄瓜，葫芦、丝瓜等，偶尔都会遇到苦的，特别是瓜把的部分，尤其苦，这种苦和苦瓜的苦是不同的，一般不主张食用。
在甜瓜的生存周期中酝酿了一定的糖分，因此会有糖分的积累，甜瓜品质的主要因子是含糖量。含糖量决定甜瓜的甜度，成熟的果实含糖量可达14%以上，其中蔗糖含量占全糖含量的70%以上，所以蔗糖含量的多少决定甜瓜品质的优劣。
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甜瓜别名香瓜：
1、香瓜不能和苦瓜以及西瓜一起吃，体弱的人吃了会出现腹泻。
2、香瓜不能和冰镇的消暑饮品一起吃，因为同为寒性食物，体弱的人吃了会拉肚子。
3、香瓜也不宜和大补的药膳或先或后一起吃，会影响药膳的功效。
4、香瓜也不宜和榴莲一起吃，两者相克，一起吃达不到各自的功效。
5、香瓜不能和黄连或者具有同等功效的药物一起吃，吃了会出现严重的腹泻。
参考资料来源：百度百科-甜瓜
参考资料来源：人民网-香瓜的营养价值和注意事项
本回答被网友采纳很多葫芦科的作物（瓜类）都有这种特点，像黄瓜，葫芦、丝瓜等，偶尔都会遇到苦的，特别是瓜把的部分，尤其苦。这种苦和苦瓜的苦是不同的，一般不主张食用，育种家也在努力通过选育培育任何条件下都不苦的品种。我们小的时候不少黄瓜都有淡淡的苦味，现在这种情况很少了。
可以确定不是农药搞的。农药苦吗？还真没尝过本回答被提问者采纳