全国医学院校排名如下：
1、北京协和医学院
北京协和医学院是中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会直属的唯一一所重点医科大学，与中国医学科学院院校一体，是中国国家级医学科学学术中心和综合性科学研究机构。
2、上海交通大学医学院
上海交通大学医学院1997年学校通过了“211工程”立项。2005年7月，上海交通大学与上海第二医科大学合并，成立了新的由教育部、上海市政府重点共建的上海交通大学医学院，进入“985”高校行列。2010年11月，学院成为卫生部与教育部合作共建的第一批十个重点高校中的一员。
3、北京大学医学部
北京大学医学部创建于1912年10月26日，是中国政府教育部依靠中国自己的力量开办的第一所专门传授西方医学的国立学校。2000年4月3日，原北京医科大学与北京大学正式合并，组建新的北京大学。2000年5月4日，北京医科大学正式更名为北京大学医学部。
4、复旦大学上海医学院
复旦大学上海医学院始建于1927年，原为国立中央大学医学院，是中国创办的第一所国立大学医学院。1985年，上海第一医学院定名为上海医科大学。学院于1959年被定为全国16所重点高等学府之一，并于1997年入选首批211工程。
2000年，上海医科大学和复旦大学合并办学，组建成为新的复旦大学。2011年，新的上海医学院成立，作为复旦大学党政的派出机构，根据学校的授权，在大医口的人才培养、科学研究、学科建设、发展规划、资源配置、对外交流等方面，行使相对独立的管理权限。
5、四川大学华西医学中心
四川大学华西医学中心，前身为原卫生部直属的华西医科大学，是最早被列入国家"211工程"的四所综合性重点医科大学之一。
2000年9月，为顺应中国高等教育改革，原华西医科大学与原四川大学合并组建新的四川大学，华西医科大学更名为四川大学华西医学中心，中心下设华西临床医学院、华西口腔医学院、华西药学院、华西基础医学与法医学院、华西公共卫生学院，统称华西五院。
