公司三体系认证办理流程如下：
1、企业资料准备阶段。本年年检过的企业的执照、资质证书、组织机构代码证、各种施工设备的检验检测报告等是否齐备。有没有根据企业的情况建立体系，形成受控文件并且运行改进。体系的建立可以自行完成，可以找咨询机构协助，咨询机构会收取相应费用，体系的文件建立一般包括三大体系的手册，二阶控制程序文件，三阶各种操作指南、规定规章等，一些记录文件等，其中环境、职业健康涉及危险源识别于很多法律法规，建议不了解还是找咨询机构比较合适；
2、申请认证阶段。当企业将所有的资料及现场都准备妥当，向认证机构提出认证申请，填写了申请表后认证机构会根据企业实际情况拟定合同，签订后合同后将进行审核阶段；
3、认证阶段。审核机构将派遣本机构审核员对企业进行审核，一般分为两个阶段，一阶段为文件审核阶段，会对企业提出一些改进意见，当企业将修改意见改正完毕后，才能安排进行第二阶段的现场审核，现场审核其实就是看企业是否按照自己建立的体系执行，会对不合格的地方提出改进意见；
4、不合格项改进与颁发证书。改进完成不审核员提出的不合格项目后，给审核员验证符合后，在结清费用的情况下，认证机构将会颁发认证证书。
企业办理三体系认证需要准备的资料：
质量管理体系认证所需要的资料：
1、企业营业执照、相关资质文件。
2、有生产现场，能正常批量生产。
3、在建项目清单。
4、公司注册满3个月。
5、租赁合同/房产证。
6、特种设备需有检测报告及备案登记。
环境管理体系认证所需要的资料：
1、企业营业执照、相关资质文件。
2、有生产现场，能正常批量生产。
3、环境批复报告/环境影响评价报告/验收报告/三废监测报告。
4、公司注册满3个月。
5、在建项目清单。
6、环保局备案登记。
7、消防验收报告。
职业健康安全管理体系认证所需要的资料：
1、企业营业执照、相关资质文件。
2、有生产现场，能正常批量生产。
3、在建项目清单。
4、公司注册满3个月。
5、消防验收报告。
6、员工普通体检报告/职业病体检报告/健康证。
企业申请产品质量认证必须具备四个基本条件：
1、中国企业持有工商行政管理部门颁发的"企业法人营业执照"；外国企业持有有关部门机构的登记注册证明。
2、产品质量稳定，能正常批量生产。质量稳定指的是产品在一年以上连续抽查合格。小批量生产的产品，不能代表产品质量的稳定情况，必须正式成批生产产品的企业，才能有资格申请认证。
3、产品符合国家标准、行业标准及其补充技术要求，或符合国务院标准化行政主管部门确认的标准。这里所说的标准是指具有国际水平的国家标准或行业标准。产品是否符合标准需由国家质量技术监督局确认和批准的检验机构进行抽样予以证明。
4、生产企业建立的质量体系符合GB/T19000-ISO9000族中质量保证标准的要求。建立适用的质量标准体系（一般选定ISO9002来建立质量体系），并使其有效运行。
三体系认证的作用如下：
1、企业实施ISO三体系标准可达到节能降耗，优化成本，改善企业形象。
2、强化品质管理，提高企业效益；增强客户信心，扩大市场份额。
3、获得ISO三体系认证已经成为打破国际绿色壁垒、进入欧美市场的准入证，并逐渐成为组织进行生产、经营活动及贸易往来的必备条件之一。
4、优化企业内部质量架构管理化，节省了各个流程的生产服务管理审核的精力和费用。
5、在产品品质竞争中永远立于不败之地、有利于国际间的经济合作和技术交流。
6、招投标强制性加分项，争取到更多发展机会。