巴以矛盾的原因有历史根源、宗教原因、民族矛盾、土和水源纷争、地缘政治因素等。
1、历史根源：新旧主人之争。从根本上来说，巴以冲突其实就是巴勒斯坦地区新旧主人之间的争斗，旧主人在3000年前占领了这里，之后离开了差不多2000年，现在回来了，和在这里居住了1300多年的新主人争土地。
2、宗教原因：一脉相承而又水火不容。犹太教和伊斯兰教，两大宗教出现的时间不同，而传承又有相通的地方，导致同一个地方先后被认为是自己的圣地，是绝对不可以放弃的地方，加上教义冲突和历史上的宗教战争，使得双方对这片土地的争夺从未停止过，直至水火不容。
3、民族矛盾：两个受伤民族复兴之路上的互相伤害。从这方面说，其实巴以冲突就是两个曾经辉煌又受过伤害的民族，都希望走上复兴之路，只是这条路只能容一个人走，两个民族不得不互相伤害。
4、领土和水源纷争：是结果也是原因。因为巴以地区总的面积就那么大，所以领土和水源的争夺是必然结果，是生存和发展的需要，而这个结果又成为新冲突的原因。
5、地缘政治因素：不稳定的中东才有利可图。巴以冲突甚至整个中东局势的不稳定，很大一部分原因是欧美的干预，以色列建国就像美国在中东打下的一颗钉子，不断壮大美国在中东的力量，为美国在中东攫取更多利益。
巴以矛盾的影响：
1、地缘政治影响
巴以冲突的持续加剧可能导致该地区局势进一步恶化，甚至引发更大规模的冲突和战争。大国在巴以问题上的立场和态度，直接影响到国际关系的稳定和发展。由于各方利益的纷争，联合国在推动和平进程方面面临着巨大的挑战。
2、经济影响
巴以冲突可能影响到能源供应的稳定性，进而对全球能源市场产生影响。长期的冲突和不稳定局势可能导致投资者信心下降，从而影响到经济发展。巴以难民对接收国的经济、社会和政治产生了压力，同时也加剧了国际社会的矛盾和纷争。
3、社会影响
战乱还导致了大量人员伤亡和家庭破碎。长期的冲突导致巴勒斯坦人民生活水平低下，基础设施落后，教育和医疗水平有限。一些极端组织利用巴以冲突扩大自己的影响力，对国际社会的安全构成威胁。巴以冲突涉及到犹太教、伊斯兰教和基督教等多种宗教和民族，冲突的加剧可能加剧这些宗教和民族之间的矛盾和对立。