幻肢痛的机制和治疗都比较复杂，与癌性疼痛、带状疱疹后遗神经痛一并被称为疼痛专业的三大顽症。因此，依靠单一的治疗方法往往不能治愈疼痛。主要的治疗方法有：
一、药物治疗
静脉注射降钙素对幻肢痛患者有效，或服用卡马西平、三环类抗抑郁药物等对长期、持续性的幻肢痛有较好效果。
二、局部痛点阻滞术
当残端部有知觉过敏和压痛点存在时，在此处使用局麻剂浸润可减轻疼痛，特别是对于幻肢痛、截肢痛的早期疼痛和病程较短的疼痛有较好疗效，一般采用反复阻滞的方法，可能治愈。
三、体神经阻滞术
对于幻肢痛、截肢痛剧烈而严重者，可行相应的体神经阻滞。一般上肢采用臂丛阻滞，下肢采用坐骨神经阻滞或腰丛阻滞，尤其是在相应的椎间孔阻滞脊神经根，效果明显。
四、交感神经节阻滞术
对出现反射性萎缩症的患者，临床表现为截肢残端烧灼痛，伴有血管运动障碍和发汗障碍，适宜施行交感神经节阻滞术。
五、断端探查手术
当采用神经阻滞术效果不佳时，可酌情实施断端探查手术。对重症幻肢痛患者一般考虑脊髓前外侧索切断术或脊神经后根切断术，术前须实行分段椎管麻醉判定疼痛与哪节神经有关。
六、心理治疗
临床见到的幻肢痛患者多数伴有心理障碍，陆先生刚入院时表现出忧郁、寡言、失眠、多疑多虑等症状，并伴有多汗、四肢皮肤湿冷等。从一定程度上来说，幻肢痛所引起的疼痛既是躯体疾患的症状，又是心理疾病的反映，两者相互作用又相互转化。目前比较专业化的系统心理治疗方法包括：普通心理疗法，即会谈疗法、支持性心理治疗、精神分析法和认知疗法；催眠与暗示疗法；生物反馈疗法及心理护理等心理治疗法等。
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