相同点
1、都是高校招生录取的特殊方式，是可以降低自己录取风险的录取捷径。
2、都有面试环节，都是可以以一个相对不那么高的高考分数进入一所理想名校的招生途径。
不同点
1、产生背景
自主招生已实行多年，是多年积累下的产物，而“综合评价”是在2016年高考改革下产生的招录方式。
2、选拔对象
自主招生主要选拔以偏才怪才为主，注重学科特长和创新潜质能力的选拔，而综合素质评价选拔的是品德优良，身心健康，综合素质较高，具有创新能力和培养潜质，有一定学科特长或特殊才能的应届高中毕业生，高校更加注重考生的综合素质。
3、学校范围
自主招生涉及全国范围内的近80所高校;综合素质评价招生涉及省内山东大学、中国海洋大学、中国石油大学(华东)、山东师范大学等9所高校。
4、报名条件
自主招生要求有奖项、专利、论文等;综合素质评价要求学业水平测试成绩至少8A或6A+奖项。
5、录取原则
自主招生考试结束后，高校会对考生定级，根据等级不同设定不同的高考分数优惠政策，部分优秀考生可以降分至一本线录取;综合评价招生的录取原则，则是综合高考成绩、综合测试成绩和学业水平考试成绩三部分，其中高考成绩占比不少于50%。
综合素质评价招生
是指在高考改革试点省的试点高等院校录取新生时，综合考量考生高考成绩、高中学业水平测试成绩、综合素质等几个维度，对高考成绩达到本二批次省控线的入选考生，综合评价，择优录取。
2016综合评价的高校包含山东大学、中国海洋大学、中国石油大学(华东)、哈尔滨工业大学威海分校、山东师范大学、山东财经大学、山东科技大学、青岛大学、青岛科技大学9所院校。