依据《建设工程质量保证金管理办法》规定，建设工程质量保证金是指发包人与承包人在建设工程承包合同中约定，从应付的工程款中预留，用以保证承包人在缺陷责任期内对建设工程出现的缺陷进行维修的资金。
而所谓缺陷责任期，则是指承包商在工程项目通过竣工验收后，对于项目工程出现质量问题承担修复义务的时期。缺陷责任期一般为6个月、12个月，最多不超过2年，具体由发承包双方在合同中约定。
工程质量保证金的主要作用，即是为了保证一旦项目工程在缺陷责任期出现质量问题，可以由施工单位负责对相应质量缺陷进行及时维修，而不致于令建设单位承担施工单位的缺陷维修责任。这对于保障建设方合法权益、保证项目工程质量有着不可忽视的重要作用，因此，工程质量保证金制度也是我国工程担保制度中的重要组成部分之一。
当然，上述内容主要是从维护建设单位合法权益与保障工程质量角度而言。对于施工单位而言，作为工程质量保证金的缴纳一方，一方面保证金数额不菲，长期占用会对企业造成很大的资金压力；另一方面建设单位拖欠工程质量保证金问题屡见不鲜，施工单位饱受困扰。因此，工程质量保证金的缴纳、退还或纠纷处理问题，有着重要的实务价值。
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工程质量保证金的缴纳
依据《建设工程质量保证金管理办法》对工程质量保证金的定义可知，工程质量保证金的缴纳，主要由建设单位从应付的工程款中预留，具体而言，参考《建设工程施工合同（示范文本）》可分为：
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一是在支付进度款时逐次扣留，在此情形下，质量保证金的计算基数，不包括预付款的支付、扣回金额；
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二是在工程结算时一次性扣留质量保证金。
两种缴纳方式各有不同，实务中在合同未有另行约定的情况下，原则上适用第一种方式，即按支付进度款逐次扣留，这也是实践中建设方常用的一种扣留方式。但需要注意的是，采用“支付进度款逐次扣留”方式，在施工方缴纳了履约保证金的情况下，会与相应管理规定发生冲突。
2017年6月20日，住建部与财务部联合发布《建设工程质量保证金管理办法》，文件第六条规定：
在工程项目竣工前，已经缴纳履约保证金的，发包人不得同时预留工程质量保证金。
即是说，在竣工前的施工阶段，发包方已收取承包方履约保证金的，不能再收取承包方的工程质量保证金。
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