铁剂治疗是治疗小儿缺铁性贫血的有效手段，口服无机盐是最经济的选择，如乳酸亚铁，含铁量为20%，是吸收的理想剂量。服用时应选择两餐之间，避免与大量牛奶同服，以免影响铁的吸收。维生素C有助于铁的吸收，可与铁剂同时服用，但应在服铁剂前4小时摄取。对反应强烈的小儿，可考虑选用副作用较小的铁之缘片，如含有阿胶和蛋白锌的产品。
对于严重腹泻或不能耐受口服的病儿，可考虑注射铁剂，如右旋糖酐铁或含糖氧化铁。但注射铁剂可能引起副作用，需谨慎使用。治疗通常需持续至血红蛋白恢复正常水平后至少6-8周，同时要补充足够的铁以备未来需要，维生素B12和叶酸无效，不应滥用。
改善饮食是缺铁性贫血的首要治疗措施，根据孩子年龄提供合适的食物，逐渐添加辅食，避免消化不良。对于因牛奶导致的慢性肠道失血，应调整饮量或换用其他替代品。肠道畸形或钩虫病需在贫血纠正后进行手术或驱虫。
输血一般仅在严重贫血、感染或手术需要时考虑，血红蛋白低于30g/L时应紧急输血，但应少量多次，防止心力衰竭。治疗后，通常在12-24小时后，临床症状如烦躁会减轻，食欲增加，骨髓和红细胞系统开始恢复，血红蛋白和网织红细胞数在用药后几周内显著上升，贫血状况得以纠正。
缺铁性贫血（iron deficiency ancemia）是小儿的常见病，主要发生在6月至3岁的婴幼儿。具有小细胞低色性、血清铁和运铁蛋白饱和度降低、铁剂治疗效果良好等特点。解放以来，各种营养缺乏症都已明显减少，但缺铁性贫血仍是常见的威胁小儿健康的营养缺乏症。根据1981年全国16省市对8435名29天至7岁小儿的调查，血红蛋白在110g/L以下的营养性贫血的患病率高达36.31%；6月至6岁小儿9027名，患病率为43.03%。因而这是儿童保健工作中急待解决的问题。