差不多。
1、学校资质
重庆医专：是一所经中华人民共和国教育部批准设立的全日制普通高等专科学校，2012年入选“卓越医生教育培养计划”，2014年被确认为重庆市示范性高等职业院校；2016年8月，入选第二批国家现代学徒制试点单位。2019年起，学校与重庆科技学院联合开办“3+2专本贯通分段培养项目”本科专业。
三峡医专：
是经重庆市人民政府批准，教育部备案的一所医药类高等专科学校。2016年8月，入选第二批国家现代学徒制试点单位。2019年起，学校与重庆三峡学院联合开办“3+2专本贯通分段培养项目”本科专业。2019年12月，重庆三峡医专入选教育部中国特色高水平高职学校和专业建设计划（第四类）。
2、师资力量
重庆医专：
学校共有教师671人，其中专任教师318人，专任教师中，中级以上职称249人，占专任教师的77.99%；拥有硕士研究生以上学历154人，硕士以上学位183人；拥有全国名老中医学术传承工作室专家1人、全国食品药品教学指导委员会药物制剂专业委员会主任委员1人、全国青少年培养导师1人；市级教学团队4个。
三峡医专：
学校有教职工1200余人，副高以上专业技术人员200余人，硕博士400余人，双师型教师占比超过80%，全国优秀教师1人、重庆市教学团队3个、重庆市教学名师2人、重庆市名中医1人、重庆市学术技术带头人1人、重庆市教书育人楷模3人、重庆市先进工作者2人、重庆市三八红旗手1名、重庆市高校中青年骨干教师4人、重庆五一劳动奖章3人。
3、专业设置
重庆医专：截至2015年12月，重庆医药高等专科学校共建有药学院（中药学院）、护理学院、医学技术学院、临床医学院、中医学院、基础部、思政部、培训部等8个教学院部，开设高职专科专业22个。
三峡医专：截至2020年4月，重庆三峡医药高等专科学校共有6个教学二级学院，设置31个专科专业。
参考资料来源：百度百科-重庆医药高等专科学校
参考资料来源：百度百科-重庆三峡医药高等专科学校