法律分析：三方协议签完后如果工作单位有管理档案的资质，档案在三方协议签订的单位，如果单位没有管理档案的资质，档案在单位指定的机构，如果没有填写单位一般会打回原籍。国家档案主管部门主管全国的档案工作，负责全国档案事业的统筹规划和组织协调，建立统一制度，实行监督和指导。县级以上地方档案主管部门主管本行政区域内的档案工作，对本行政区域内机关、团体、企业事业单位和其他组织的档案工作实行监督和指导。乡镇人民政府应当指定人员负责管理本机关的档案，并对所属单位、基层群众性自治组织等的档案工作实行监督和指导。
法律依据：《普通高等学校毕业生就业工作暂行规定》 第九条 高等学校的主要职责：1、根据国家的就业方针、政策和规定以及学校主管部门的工作意见，制定本学校的工作细则；2、负责本校毕业生的资格审查工作，及时向主管部门和地方调配部门报送毕业生资源情况；3、收集需求信息，开展毕业生就业供需见面和双向选择活动，负责毕业生的推荐工作；4、按照主管部门的要求提出毕业生就业建议计划；5、开展毕业教育和就业指导工作；6、负责办理毕业生的离校手续；7、开展与毕业生就业有关的调查研究工作；8、完成主管部门交办的其他工作。