因为这场雨早不下晚不下，刚好诸葛亮火烧司马懿的时候就下雨浇灭了这场火，诸葛亮看出来是天意注定司马懿命不该绝，他不想逆天而行所以就没有下令放箭。
《三国演义》中有一节写到，司马懿被诸葛亮用计困在了上方谷中，此时诸葛亮根据地形优势选择了用火攻，一捆一捆的柴火被浇上油之后再点燃，然后被蜀军士兵推入到上方谷中。司马懿带领的魏军猝不及防，在诸葛亮的火攻之下狼狈不堪，不少人被大火烧死烧伤，想从山谷下爬上来，却又被蜀军推下的石头给挡住了，山上的石头像奔雷一样滚下来，砸死了不少魏兵。
眼看司马懿和魏军在这一战中就要全军覆没，可本来晴朗的天气，这时却偏偏飘来一片乌云下起了大雨，很快就把山谷中的大火浇灭了，魏军也因此得到了喘息的机会。诸葛亮看到如此情况不禁皱起了眉头，他伸出手掌掐指一算脸色就变白了，犹豫了一会便对天发出一声长长的叹息，然后下令撤兵放过了司马懿。看到这里不少人就奇怪了，诸葛亮为什么会放过司马懿呢，即使大火被雨浇灭了，也可以放箭把司马懿和魏兵都射死啊，足智多谋的诸葛亮应该知道这样做才对，他为什么不下令放箭呢？
我们知道古时候的人是非常迷信玄学的，而诸葛亮就是一位掌握了玄学的高手。他看到老天下雨救了司马懿，然后掐指一算，知道上天注定司马懿此时命不该绝，自己即使再努力也杀不了司马懿，而且自己继续加害司马懿就是逆天而行，所以他深深为蜀国的未来担忧，知道自己很可能无法帮助刘备完成统一三国的大业了，所以他长长叹了一口气之后，就下令三军将士退兵放过了司马懿。
本回答被网友采纳因为诸葛亮本来就是有意放走司马懿的！我们都知道，一代奇才诸葛亮，可谓是无数文人士子争相膜拜的千古人臣之表，也是中国文明数千年以来，我们最敬仰的传奇人物之一！他的鼎鼎大名，在中国，几乎无人不知，无人不晓！
诸葛亮当年的那些事迹，大家也都如数家珍！特别是晚年的孔明，统领蜀国之军政，数次出兵北伐，和魏国都督司马懿对峙在渭滨两岸，两人棋逢对手，惺惺相惜；
可惜，年不假年，最终诸葛亮还是没有完成自己的抱负和夙愿，就撒手人寰“星落五丈原”！不过，他最后还是用“上方谷奇谋”，告诉了司马懿，自己的才能，更胜他一筹！但是，人算不如天算！
尽管诸葛亮用一系列的缜密谋划把司马懿已经逼入了绝境，但是“天意不可违”！当时，上方谷天降大雨，把诸葛亮早已布置好的火攻，彻底胎死腹中！这场大雨，不仅让诸葛亮的计划功亏一篑，更是彻底浇灭了他“克复中原”的理想！
但是，这件事情的背后，恐怕远远没有那么简单！比如说，对于诸葛亮来说，他精通奇门遁甲，星象卜算之术，预料天象的变化，本来就是他的“强项”！事先，上方谷会降下倾盆大雨，他不可能不知道！
而且，诸葛亮打造的“连弩”威力我们想必都有所耳闻！当时，尽管他火攻失败了，但是，他完全可以调遣一队弓弩手，万箭齐发，司马懿一定会当场阵亡，但是，他也没有这么做！
所以，种种迹象表明，他其实是故意放走司马懿的！原来，他明白中原战乱，就算自己此时杀了司马懿，也于事无补，他时日不多，蜀国也不可能“克复中原”了！
但是司马懿一统天下的抱负，他早在多年的交锋中心知肚明！他认为，让司马平定三国，说不定，会让中原老百姓有好日子过！所以，他才故意在上方谷之战中，展示了自己高超的智谋后，放了司马懿一条生路！
如果诸葛亮真的有机会干掉司马懿，他会放掉司马懿吗？答案是肯定不会的。那么为什么诸葛亮火烧上方谷，明明有机会出掉自己最强劲的一个对手，确认尤其逃脱呢？其实答案很简单，因为罗贯中不敢让诸葛亮干掉司马懿，当然罗贯中同样也不敢让司马懿干掉诸葛亮，否则，罗贯中就妥妥的成为了篡改历史的第1人。
事件回顾
诸葛亮作为丞相统领蜀国多年，一心想要灭掉魏国完成一统天下的愿望，但多次违法均未如愿，很大的原因就是因为他有一个非常强劲名叫司马懿的对手。终于，在诸葛亮第6次率军北伐之时，诸葛亮运用自己的聪明智慧，为司马懿设下了一个大大的陷阱。诸葛亮在上方谷设置了一个致命的诱饵，引得司马懿父子带兵深入上方谷中，然后下令军士万箭齐发火烧了司马懿的大军，眼看司马懿即将成为一只火烤的“螃蟹”，此时天空中突然下起一场意外的大雨，将熊熊大火给扑灭了。
虽然此时大火已经被扑灭，但是司马懿却早已损兵折将，处在地理和人员优势的诸葛亮仍然有机会将司马懿一网打尽，但是奇怪的是，诸葛亮却仰天长叹一声，轻易就放过了司马懿，使得司马懿最后能够重整旗鼓，反而逼得诸葛亮大军最后仓促返回蜀国，诸葛亮因病辞世。
事件结论
很多人说，诸葛亮之所以放过司马懿，一是因为诸葛亮和司马懿惺惺相惜，不忍真的出掉司马懿。二是因为诸葛亮过于迷信，认为这场雨之所以来的这么出其不意，是因为上天不希望司马懿死，诸葛亮不愿逆天而行，其实，事实并非如此，如果诸葛亮不愿逆天行事，又怎么会想要摆下七星灯为自己续命。
事实是诸葛亮一心想要干掉司马懿，不过可惜，在正史中既没有发生诸葛亮火烧上方谷差点儿干掉司马懿一事，也没有诸葛亮比司马懿活得更长久的史实，所以罗贯中也不敢和正史对着干，只能虚构了一段情节来表示自己的抑曹扬刘之情。
诸葛亮下令放火将司马懿等人活活烧死在谷中。可惜那次天上却下起了大雨，一场大雨让这场火熄灭了，诸葛亮杀掉司马懿的计划失败。诸葛亮擅长军事谋略，天文地理等多种学识，下雨的事情诸葛亮应该能够算到的，就算是那百分之一的机会让司马懿赚到了，诸葛亮也有机会杀掉他的。看着被火攻控制无法出谷中的司马懿，诸葛亮都没有下令放箭。
司马懿和诸葛亮之间的对抗作者是花了许多笔墨的，诸葛亮是个足智多谋的人才，但司马懿却也不是个善茬，同样也是个不好对付的人，诸葛亮也被他消耗了很多时间，于是他这天准备的充分，想把司马懿给一下火化了，这还多亏于他的计谋用得好，司马懿当真还上钩了，诸葛亮看到时机到了，点燃了火，司马懿这时候被围在了熊熊大火中，他这时候估计想到自己这辈子算是完了。
其实当时就算是万箭齐发，也不杀死司马懿！当时的弓箭制作技术已经算不错的了，可是那也是弓箭，并不是现在的枪炮，古代百步穿杨的箭术已经是罕见了，再远的话箭在空中就会发生偏移，加上下雨天气，强风与降雨都会影响弓箭，就算能射准司马懿，那也杀不死司马懿！科学技术跟不上，怪不得其他。
也正是因为司马懿成功的突围，诸葛亮失去了最后翻盘的可能。在之后的几场战斗中，不论蜀军如何邀战、骂战，魏国大军都坚守不出，再加上诸葛亮多年以来操心蜀汉政权，身体每况愈下，最后类似在五丈原上了。也正是因为诸葛亮的死去，蜀汉政权最后的顶梁柱断了，没过多久邓艾率领的大军直接兵临成都城下，后主刘禅投降，蜀汉宣告灭亡。
本回答被网友采纳