如果本科毕业论文被省教育厅抽检不合格，通常会面临以下几种情况：
1、学校会收到通知并告知学生，学生需要提供详细的解释和说明，并说明是否需要重新提交论文或参加补考。
2、学校会组织专家对论文进行再次审核，并提供额外的指导或支持，帮助学生改进论文质量。
3、如果论文存在较为严重的学术不端行为，学校可能会依法撤销已授予学位，并注销学位证书。
对于学校来说，会采取以下措施来应对这种情况：
1、学校会认真对待省教育厅的抽检结果，并根据相关程序进行调查核实。如果确实存在问题，学校会依法依规处理，并督促学生和教师加强学术诚信建设。
2、学校会加强对学生论文的监督和指导，提高论文质量，避免类似问题再次发生。
3、学校还会加强与省教育厅的沟通和联系，及时了解相关政策和要求，积极配合工作，共同促进高等教育的发展。
首先面对查重不合格时的应对策略：（1）对原文进行深度修改和重写，以降低重复率，突出论文的原创性；（2）合理引用与标注，确保所有借鉴和引用的内容都得到了恰当的标明和说明；（3）利用查重报告，准确识别高相似度的部分，针对性地进行修改和优化；（4）与导师紧密合作，根据查重反馈优化研究方案和论文结构，寻求专业指导和建议。。
其次过度依赖查重系统可能抑制学生的创新思维和独立研究能力。因此，除了技术层面的处理方法外，本研究还强调培养学生的研究能力和学术道德观念，鼓励学生进行原创性研究，最终提高整个学术界的研究水平和创新能力。提出了几点建议，增强查重系统对学术引用的识别能力，拓展数据库覆盖范围，以及提升算法对于不同类型文献的区分能力等。
最后，面对查重不合格的情况，学生应主动采取行动，高校也应提供有效的支持系统，包括提供专业的写作指导、开展学术诚信教育和增强学生的信息素养等，共同构建一个高质量、高原创性的学术环境。尽管技术手段对维护学术诚信至关重要，但培养学生和学者的学术道德和诚信意识同样重要。教育机构和学术组织应加强对学术诚信的教育和宣传，从根本上减少查重不合格事件的发生。