邵阳学院图书馆的管理体系采用校长领导下的馆长负责制，馆长由校长直接任命，负责全馆的行政和业务决策。副馆长们根据需要协助工作，分工明确。
图书馆内部设有多个部门以满足工作需求：
行政办公室（馆办公室）: 负责行政管理，组织活动、协调工作，处理考勤、卫生和安全事务，以及读者借阅证的管理和办公用品的管理。
采编部: 负责图书采访、验收、分类、编目等工作，采用专业标准进行文献标引和编目处理。
流通部: 主要负责读者借阅、赔罚款处理、书库管理以及满足教学、科研和读者需求，同时提供新书推荐和咨询服务。
阅览部: 负责报刊管理、外借及阅览，维护机读目录，提供新进文献推荐和阅读辅导，处理阅览责任事故，并接受读者咨询。
信息咨询部: 主要负责信息咨询、数据库服务、检索支持，为教学科研提供服务，同时开展网络服务、电子阅览室管理以及与省内外机构的合作。