建议选择重庆大学电气工程专业。
第一，两所学校都是985大学，当然论综合实力肯定是东南大学要强一些，但是重庆大学也不差。
重庆大学创办于1929年；1942年，学校成为综合性大学；1952年调整为以工科为主的多科性大学；1960年被确定为全国重点大学；1996年成为国家“211工程”重点建设高校，1999年列入国家“985工程”重点建设高校；2000年5月，原重庆建筑大学、重庆建筑高等专科学校与重庆大学合并组建为新的重庆大学 。
1952年，以原南京大学工学院为主体，并入复旦大学、交通大学、浙江大学、金陵大学等学校的有关系科，在中央大学本部原址建立南京工学院；1988年5月，学校复更名为东南大学；2000年4月，原东南大学、南京铁道医学院、南京交通高等专科学校合并，南京地质学校并入，组建新的东南大学 。
第二，电气工程专业的就业比交通工程面要广，相对好的多。不管是以后去电网公司还是去企业。
对于很多人来说，读大学不就是为了找份好工作嘛，在选择大学和专业的时候还是要慎重选择，特别是在专业的选择上，基本上可能就决定了以后工作的行业。
当然，有的人可能会纠结于东南大学比重庆大学要稍微好一点，毕竟排名要高一些。但大家都是985大学，这个时候专业就显得更加重要了。男怕入错行，专业可能会影响一辈子。
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东南大学的交通工程专业和重庆大学的电气工程专业都是实力很不错的专业，而且这两门专业所设置的专业内容和毕业后就业发展方向是不同的，考生需要结合自己的兴趣以及未来的就业发展规划来选择，比如如果自己对交通工程专业感兴趣，而且毕业之后也想往交通运输行业发展，那么选择交通工程专业就很合适了，相反，如果考生对于电气工程专业有学习的兴趣，那么就应该选择报读重庆大学的电气工程专业，下面，小匠老师跟大家来介绍下交通工程专业和电气工程专业的学习内容和就业发展前景。
东南大学是我国重点建设的985工程大学，交通工程专业是东南大学的一门王牌专业之一，也是考生们所报考的一门热门专业，交通工程专业属于理工类专业的范畴，这一门专业学习起来有一定的难度，学生们需要学习到多门的课程，交通工程专业的主干课程主要包括道路勘测设计、交通运输工程、工程力学基础、交通工程设计、道路施工监理、道路工程制图、道路工程、公路建设法规等。
交通工程专业主要培养的是具备交通工程专业基本知识，能够从事交通工程规划、交通地铁土建施工工程以及交通工程设计的高级工程技术和科研人才，学习交通工程专业的毕业生，能够拥有很不错的就业发展前景，毕业生的就业面也比较广，交通工程专业毕业出来的学子，可从事交通规划、设计、监管等方面的技术和管理工作，可以选择进入公路局、地铁施工公司、建设局或者高速公路养护公司的单位工作。
电气工程专业也是属于理工类专业的范畴，重庆大学的电气工程专业也是非常有实力的，很值得考生报考，电气工程专业的主要课程包括有数字电子技术、电工学、电力电子技术、供电技术、电气控制技术、电气工程专业英语、电气系统自动装置原理、自动自动控制原理等。
电气工程专业主要培养的是具备电气工程基本知识和理论，能够在电气工程、电力电子技术电子与计算机技术的领域，从事系统分析、工程设计、系统检测、研发等方面工作的高级工程技术人才。学习电气工程专业，毕业后有希望能够进入国家电网工作，社会对于电气工程专业的人才需求量也呈上升趋势，因此，学习电气工程专业也是很有前途的。
总而言之，电气工程专业和交通工程专业都是很不错的专业，考生需要结合自己的兴趣来选择。
国家重点一级学科
清华大学
浙江大学
华中科技大学
重庆大学
西安交通大学
………………
国家重点二级学科
080801电机与电器
河北工业大学
哈尔滨工业大学
沈阳工业大学
080802电力系统及其自动化
天津大学
华北电力大学
西南交通大学
海军工程大学
080803高电压与绝缘技术
哈尔滨理工大学
080804电力电子与电力传动
中国矿业大学
合肥工业大学
………………
国家重点（培育）学科
080802电力系统及其自动化
上海交通大学
山东大学
080804电力电子与电力传动
南京航空航天大学
西南交通大学
080805电工理论与新技术
湖南大学