Windows98继承了先前各种版本Windows系统的图形用户界面、多任务处理等特点，并增强和增加了许多新的特点。
（1）图形用户界面
Windows98基于窗口的图形用户界面GUI（Graphic User Interface）为用户提供了独特的操作环境，使用户与应用程序之间的交互更为直接与简捷。它提供了丰富的系统菜单，同时每个程序与文档都有自己的图标，用户只要用鼠标点击图标或菜单项，就能完成各种操作。除此之外，Windows提供的GUI还带来了用户界面的一致性，使用户不必将大量时间和精力花费在不同软件的学习使用上，Windows一致的应用程序外观和操作方式，使用户可举一反三，很快熟悉和掌握各种在Windows下运行的各种不同应用软件的操作，大大提高工作效率。
（2）多任务处理
Windows98是一个单用户多任务的操作系统。用户可以同时运行多个程序、共享系统资源、执行多项任务，并且可以方便迅速地在各程序和各任务之间切换。例如，你不必退出正在进行的文字处理程序就可以转去作电子表格的工作或玩“纸牌”等游戏；或者在用“画笔”程序作画的同时，通过网络下载Interact上感兴趣的信息。
（3）内存管理
Windows98是一个真正32位的操作系统，提升了内存管理能力和高速缓存的效率。它突破了MS-DOS只能管理640KB基本内存的限制，能够对高达4GB的内存空间进行动态管理。此外，它可以利用硬盘作为虚拟内存，使运行在Windows下的程序在任何时候都可以将超过实际内存大小的代码提交系统运行。
（4）信息交换
Windows为其应用程序之间的信息交换提供了三种标准机制。即：剪贴板Clipboard（静态数据交换）、DDE（动态数据交换）、OLE（对象链接和嵌入）。利用剪贴板，大多应用程序的数据可以相互交换、充分利用。利用DDE和OLE，可使信息交换自动完成，’并且在一个程序中对某个数据的修正，立即会在另一个有关的程序中反映出来。
（5）即插即用
Windows能自动检测新增加的硬件设备，并为其作各种必要的系统配置。在此基础上，Windows98增加了对通用串行总线USB的支持，使数据输入与输出的速度更快，使设备检测能力更为强大。并支持热插拔，使新一代的外部设备也能够即插即用。
（6）多媒体技术
Windows98增强了对多媒体应用的支持。可以管理CD-ROM或DVD驱动器，管理声卡、MIDI、录音、CD唱盘和视盘等设备，并提供新的媒体播放程序与声音记录程序等。从而使电脑可以更好地处理声音、图像、文字、动画等多媒体信息，并使个人电脑更具有娱乐性。
（7）TrueType字型技术
Windows为应用程序提供了多种显示字体和打印字体，特别是它支持的TrueType字型技术，可以对文字进行不同大小的任意缩放和作各种修饰，实现无级变化。利用这种技术，屏幕显示和打印的文字均可达到“所见即所得”的直观效果。
（8）网络支持
Windows在安装过程中，可自动识别网络的存在，提供上网和联机服务。支持电脑拨号、超级终端、网上邻居等多种网络应用。Windows98更是做到了与Internr的完美结合，内置Internr EXplorer浏览器与Out look EXpress电子邮件收发软件。此外，用户还可以利用频道订阅Web站点，利用活动桌面直接将Web页面设置在用户桌面上，并可以从任何位置转向Internr。
（9）支持长文件名
Windows98支持多达255个字符的长文件名，用户可以根据需要为自己创建的文件用描述性较强的文字进行命名。如命名为：“Windows98的网络功能”。
为了与MS-DOS及以前版本的Windows兼容，Windows98的文件名的扩展名仍没有被消除，只是在缺省情况下它们被隐藏了起来。
（10）FAT32文件系统
Windows98增强性的FAT32文件系统可有效地存储文件，节省硬盘空间，并使可管理的硬盘空间迅速增大，是原FAT16系统的1000倍。
（11）支持MS-DOS应用程序
在Windows98下，MS-DOS的命令与应用程序仍可以在高分辨率的图形方式下运行，并可同时运行几个MS-DOS应用程序。Windows98提供了多种切换到MS-DOS命令行方式的方法，还为窗口式的MS-DOS应用程序提供了鼠标操作支持。