政府秘书长职责：协助处理安排政府的日常工作，协助政府领导分管编制，审计，监察，督查工作，协调各副秘书长之间的工作，协调政府领导处理出访审批，分管比较大的工作。级别，省政府秘书长为正厅级，市政府秘书长为正处级。
政府办公厅主任职责:主持政府办公室的全面安排，负责政府会议工作和理要活动安排，协助政府领导组织会议决定事项的实施，负责政府办公室主任的岗位培训教育工作，负责政府领导交办的工作，分管比较细的工作，省政府办公厅主任级别，市政府办公室级别都是和政府秘书长同级。
1、职责不同：
政府秘书长职责：协助处理安排政府日常工作及协调各副秘书长之间的工作；协调政府领导处理出访审批。
政府办公室主任职责：主持政府办公室全面工作，负责办理政府领导交办的其他工作。
2、分管方向不同：
政府秘书长分管方向比较大。秘书长是在党委书记的领导下负责党委日常工作，也就是省党委机关的协调工作。
政府办公厅主任分管方向比较小。办公厅主任就是主持办公厅的工作。
拓展资料
办公厅是党政机关设立的负责协助机关领导处理机关日常工作并主管文秘和机关行政管理事务的综合职能部门。办公厅在其所属党政机关的领导下依职责行事，并办理机关及其领导交办的事项。
职责：
（一）协助委领导组织协调机关日常政务工作。
（二）负责委党组会议、委主任办公会议、委主任碰头会、委领导召集的协调会议、司局长通气会，以及我委召开的全国性或全系统大型会议的会务工作；起草有关会议纪要，编辑委内日常政务信息，负责主送委领导的签报工作；负责全委值班工作，协助领导处理紧急事项。
（三）负责全委的文件、电报、资料的收发、批分、核稿、印发；掌管委、厅印章，指导全系统公文办理工作。
（四）负责党中央、国务院及领导同志交办的重要事项，委党组会议、委主任办公会议、委主任碰头会等确定的重要事项，和全委公文运转的催办督查工作以及政务公开工作。
（五）负责全委全国人大代表建议、全国政协委员提案办理的综合协调、组织催办、指导管理以及有关联络工作。
（六）组织协调和指导管理全委政务信息工作；负责向中央办公厅、国务院办公厅、中央财经领导小组办公室报送《国家发展改革委信息》；编印《经济情况与建议》、《国家发展改革委通讯》等内部刊物；负责全委内部简报的管理。
（七）归口管理和指导协调全系统电子政务建设，研究制定委电子政务建设规划和规章制度；负责机关电子政务建设和应用，保障信息安全，管理建设经费。
（八）负责综合协调、接待联络、指导管理全委来信来访工作，制定工作制度；负责与信访部门联系，汇总编辑来信来访情况
参考资料：百度百科 办公厅
本回答被网友采纳秘书长负责领导人的工作安排和生活安排以及退休干部的养老。督导各个岗位的工作秘书和生活秘书的工作。
办公厅主任只负责领导人的工作安排，办公厅的全面工作。生活安排和养老一般由机关事务局负责。
办公厅与机关事务如果不分开就只设一个秘书长。如果工作和生活分开就设一个办公厅主任和一个机关事务局局长。