养殖场饮用水消毒的目的是杀灭或除去水中的致病微生物,防止动物饮用后发生传染性疾病。水中的致病微生物的种类有致病性的细菌、病毒和原虫。引起人或动物发病的传染病有多种是经水传播的，养殖场生产过程中使用已被污染的水可能引起多种疾病的发生和传播。动物的饮用水和人的饮用水卫生安全指标是一致的。《生活饮用水卫生标准》（GB 5749-2006）规定饮用水消毒细菌学指标应达到如下标准：菌落总数≤100 CFU /mL；总大肠菌群不得检出；游离余氯在与水接触30分钟后应不低于0.3 mg/L，集中式给水除出厂水应符合上述要求外,管网末梢水不应低于0.05 mg/L。。
饮用水消毒剂应具有如下特点：无毒、无刺激性；能迅速溶解于水并能快速释放出杀菌有效成分；对各种天然水中所含的各种类型的致病微生物都有强烈的杀灭作用；不与水中的无机物和有机物起反应或产生有毒的化合物；作用时操作简单方便。
几种常用于饮用水消毒的消毒剂及消毒方案：
1、二氯异氰脲酸钠粉（以消毒威为例，含有效氯30%） 氯制剂用于饮用水消毒仍是各国广泛采用的方法。用二氯异氰脲酸钠粉消毒饮用水，一般要求消毒30分钟后余氯不低于0.3mg/L，故视水源水质的不同，消毒威的添加量应作相应的调整。如：井水非常洁净,几乎不含有机质和病源微生物,对有效氯的消耗也少，每吨水加2-3克消毒威，即添加有效氯至0.6mg/L-0.9mg/L，余氯浓度即可符合国家标准；自来水已经过消毒，按国家标准在出水口余氯不得低于0.05mg/L,故只需添加消毒威2-3克,即可使余氯浓度达到0.6mg/L-0.9mg/L，；地表水(池塘水、河水等)含有机质等杂质较多，携带的病源微生物多，必须先经过净化处理，沉淀、除去杂质后，再经消毒程序，动物方可饮用。在实际应用中，视水质状况的不同，加入消毒威的量应作相应调整，一般以每吨水加入消毒威4-15克为宜，若加入13g的消毒威，有效氯浓度为4 mg/L，可达到良好的消毒效果。消毒威的添加量是否适宜,一个简单的判断方法是：以加入消毒威处理饮用水十分钟后，以手蘸水，能闻到轻微的氯嗅味为宜。加入消毒威的量不宜太多，太多则氯在水中的残留多，以致饮用水口感不好并有难闻的气味，影响动物的饮用。使用时应先将消毒威用适量水溶解，再倒入水中，使之能分散均匀。
2、二氧化氯（以绿力消为例，含二氧化氯8%） 二氧化氯是一种广谱、高效、速效、低毒的消毒剂，是目前世界卫生组织认定的唯一A1级安全消毒剂，是城市直饮水广泛采用的消毒剂，用于饮用水消毒的主要优点有：
（1） 杀菌效率高，不但能杀灭水中的各种微生物，还能杀灭原虫和藻类；
（2） 二氧化氯溶于水时无臭无味，且能有效清除饮用水中产生气味的微量化合物，从而除去异味；
（3） 能提高絮凝作用，沉淀水中的铁和锰，使之形成不溶物而过滤去除，有利于控制和清除水的颜色，改善饮用水的清洁度；
（4） 可直接氧化水中的腐植物及三氯甲烷前体物，因此反应不产生三氯甲烷（THM）和其他有害物质；
（5） 能破坏水中的酚类、硫化物类、氰化物类、亚硝酸类及其他有害化合物，特别是对能产生臭味的酚的控制效果好，从而达到了提高水质和除臭作用。
在实际使用过程中，采用绿力消进行饮用水消毒，同样应视水源水质不同来确定绿力消的添加量。每吨井水、自来水添加绿力消3-5克；地表水(池塘水、河水等)同样需先经过净化处理，沉淀、除去杂质后再加入绿力消进行消毒，一般以每吨水加入绿力消6-15克为宜，若加入15g的绿力消，ClO2浓度为1.2mg/L，对中度污染的水源可达到良好的消毒效果,加入的绿力消稍过量不会产生难闻的气味。使用时应先用适量水按说明将绿力消活化使之产生二氧化氯。如果将绿力消不经活化直接加入大量水中，其中的亚氯酸盐不能转化为二氧化氯，将会严重影响绿力消的消毒效果。
3、碘制剂（以碘酸为例，碘酸总含量15%） 碘制剂也是常用的饮用水消毒剂，特点是碘酸所含的碘对病毒有良好的杀灭能力，且在水中易被消耗，不会产生三氯甲烷等副产物；所含的表面活性剂具有持久的抑菌能力。井水、自来水等洁净水源每吨水添加碘酸50g，地表水(池塘水、河水等)经净化处理后视水质状况可适当加量，以每吨水添加100g-200g为宜。经试验，每吨水碘酸添加量加大至2?，未发现饮用水有异常气味，也未发现动物有拒饮现象。
养殖场的消毒要轮换使用不同的消毒剂，饮用水的消毒剂也要进行轮换，以达到良好的消毒效果。不论使用何种消毒剂，均应将消毒剂适当稀释后再加入到饮用水中，以使消毒剂能均匀分散。
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