三国之后的魏晋时期，西晋医学家皇甫谧搜求古典医籍，遥宗古人妙术，除著有《依诸方撰》等之外，主要有《针灸甲乙经》12卷，作为第一部针灸学专著流传后世，在我国医学史上产生了深远的影响。
《针灸甲乙经》是一部汇编性著作，它是根据《黄帝内经•素问》、《针经》、《明堂孔穴针灸治要》3部书的内容编纂而成的。皇甫谧认为“三部同归，文多重复，错互非一”，于是“除其重复，论其精要，至为十二卷”。主要目的则在于便于学习，便于应用。
《针灸甲乙经》的128篇内容可大致分为两大类：第一类论述人的生理功能、人体经脉、骨度、肠度及胃肠所受、俞穴主治、诊法、针道、生理病理等；第二类则为临床治疗部分，包括内外妇儿各科，尤以内科为重点。
《针灸甲乙经》中关于针刺操作手法，从理论到具体操作要领，均作了比较具体的叙述，既具有对前代经验的总结性，又富有一定的创造性，无论从文献学价值和指导后世针灸发展都有着重大的意义。《针灸甲乙经》的著成，对于我国针灸学的发展起到了极大的促进作用，宋、金、元、明、清重要针灸学著作基本上都是在本书的基础上来完成的。国外早已有本书的英译本，对国外针灸学的发展也有重要的影响。