公元1368年，朱元璋称帝，建立明朝，定都在应天，就是现在的南京。1420年朱棣迁都至顺天府，以应天府为陪都。元末民不聊生，爆发红巾起义，朱元璋加入郭子兴队伍。1364年朱元璋称吴王，建立西吴。1368年朱元璋称帝。明朝是一个由汉族建立的大一统王朝，共传十六帝，享国二百七十六年。朱元璋在位期间对各个方面都进行了改革，政治上废丞相，设承宣布政使司、提刑按察使司、都指挥使司分掌权力，进一步的加强了中央集权， 严惩贪官和不法勋贵；军事上实施卫所制度，北伐残元；经济上大搞移民屯田和军屯，兴修水利，解放奴婢，减免税负，派人到全国各地丈量土地，清查户口等 。
文化上紧抓教育，兴科举，建立国子监培养人才 ；对外加强海外交流，恢复中华宗主国地位 。经过洪武朝时期的努力，社会生产逐渐恢复和发展了，史称洪武之治。明朝是继汉唐之后的黄金时期。明代，无汉之外戚、唐之藩镇、宋之岁币，天子守国门，君王死社稷。清朝康熙皇帝对明太祖评价为治隆唐宋。
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大明国号来源有多种说法，一般认为与宗教有关，吴晗等人认为，大明国号的源头是明教，此说后来被金庸等作家采用，而胡阿祥等认为此国号出自白莲教，而源头则是佛教。朱元璋手下有一部分明教徒，用“明”作国号以示正统地位，也同时应和明教中的“明王出世”预言。
其次，以明喻火，根据五德终始说，表示明朝取代元朝是以火克金。又因皇室姓朱，称朱明。1644年北京陷落后，南方各地先后拥立明朝宗室建立朝廷，沿用大明国号，别称南明或后明，清人称之为伪明，奉大明正朔的郑芝龙在东南沿海建立了明郑势力，后其子郑成功及其孙郑经在台湾建立的政权又称为明郑时期。
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定都于应天府。
应天府，或称京师，是南京在明朝时期的名称，为明朝前期首都，后永乐时期迁都顺天府，应天府作为留都。应天府下辖上元、江宁、句容、溧阳、溧水、高淳、江浦、六合八县。
元末民不聊生，爆发红巾起义，朱元璋加入郭子兴队伍。1364年朱元璋称吴王，建立西吴。1368年朱元璋称帝，国号为大明 ，因皇室姓朱，又称朱明，定都于应天府；1420年朱棣迁都至顺天府，以应天府为陪都。明初历经洪武之治、永乐盛世、仁宣之治等治世 ，政治清明、国力强盛。
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应天府名称由来：
元朝前期的建康路，后期改为集庆路，在明朝初年改名为应天府。应天之名，可以上溯到宋朝的南京应天府，而濠州红军隶属的龙凤政权，正以复“宋”为号召，集庆路又是位于龙凤南境的大都会，事似合理。但是，“应天”意指“上应天意”。
洪武二年九月始建新城，洪武二年六年八月成。内为宫城，是紫禁城，城门一共六个：正南面是午门，左边是左掖门，右边是右掖门，东是东安门，西是西安门，北面是北安门。
宫城的外面试六个门：正南面是洪武门，东是长安左门，西是长安右门，东部的北面是东华门，西的北面叫西华门，北面的叫玄武门。
皇城的外面是京城，周九十六里，一共有十三个大门：南面是正阳门，南的西叫通济门，又往西是聚宝门，西南是三山门，称为石城门，北面是太平门，北面的西边是神策门，称为金川门，或者钟阜门，东面是朝阳门，西是清凉门，西边北方是定淮门，称为凤凰门。后塞钟阜门、仪凤门，存留下十一个门。
外城是洪武二十三年四月建，周围一百八十里，有十六个城门：东边是姚坊门、仙鹤门、麒麟门、水波门、高桥门、双桥门，南边是上方门、夹冈门、凤台门、大驯象门、大安德门、小安德门，西边是江东门，北边是佛宁门、上元门、观音门。
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1368年初称帝，国号为大明，定都于应天府。
元末爆发红巾起义，朱元璋加入郭子兴队伍。1364年称吴王，史称西吴。1368年初称帝，国号为大明，定都于应天府；1420年朱棣迁都至顺天府，以应天府为陪都。明初历经洪武之治、永乐盛世、仁宣之治等治世，政治清明、国力强盛。
中期经土木之变由盛转衰，后经弘治中兴、嘉靖中兴、万历中兴国势复振，晚明因东林党争和天灾外患导致国力衰退，爆发农民起义。
1644年李自成攻入北京，崇祯帝自缢，明朝覆亡。明朝宗室在江南建立南明，随后清朝击败大顺、大西、南明弘光、隆武、绍武等诸政权。1662年永历帝被杀，南明覆灭。1683年清军攻占台湾，奉明正朔的明郑覆灭。
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1275年，元兵从雨花台进入建康城。元军占领建康后，设建康府宣抚司。天历二年（1329年），改建康路为集庆路。
元至正十六年（1356年），朱元璋亲自带兵分三路用十天时间攻破集庆路（今南京）。明太祖丙申年（1356年）三月，改集庆路名为应天府。
洪武元年（1368年）八月，以应天府建为南京，以开封府建为北京。
洪武十一年（1378年）正月，罢北京开封府，改南京称为京师。
永乐元年（1403年）正月，京师改称“南京”；改北平府（今北京）名为顺天府，建为“北京”，称为“行在”。
永乐四年（公元1406年），朱棣下诏迁都北京顺天府，遂开始全面营建北京城。
永乐十九年（公元1421）正月，朱棣正式迁都北京顺天府，改北京名为京师；设南京应天府为留都，形成了南北“两京制”。朱棣称帝后的南京，虽然有完整的机构，但实际上已流于形式。
清顺治二年（1645年），清兵攻克应天府，改应天府为江宁府，改南直隶为江南省。
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