疫苗的免疫程序在各个养兔场，各种不同用途的兔群，各种不同饲养方式的情况下是不可能相同的。要达到免疫程序和实施方案的合理，应根据不同情况制定切合实际的程序。
（1）应考虑各个不同品种兔群间的免疫基础，即种兔群的免疫状况决定了仔兔的母源抗体的水平，因而决定了疫苗首次免疫的日龄。
（2）应考虑各种不同用途品种间的差异，对于种用兔、毛用兔等饲养周期较长的兔群，其免疫程序应综合考虑系统免疫，而且各种疫苗的免疫接种时间，尽可能地在产仔前全部结束。
（3）应考虑本地区内发生疫病的种类、流行情况。一般情况下，常发病、多发病而且有疫苗可预防的应重点安排。而本地从未发生过的疫病，即使有疫苗，也应慎重使用。
（4）应考虑本单位的管理水平和环境控制的程度，管理制度严格，各种防疫措施有力，环境控制得较好，各种病原入侵的机会相对减少，即属于相对安全区域，反之管理松散，防疫制度名存实亡，各种疫病常发，则属于多发病区域。这两种不同区域的免疫程序和疫苗种类的选择是根本不同的。
（5）应考虑选用疫苗的免疫特性，产生免疫力的时间，免疫期的长短。各种疫苗的免疫期及产生免疫力的时间是各不相同的。一般情况下，应首先选用毒力弱的疫苗作基础免疫，然后再用毒力稍强的疫苗进行加强免疫。
（6）为使免疫更合理、更科学化，并通过实际的免疫效果检验免疫程序，应考虑建立免疫监测制度，根据免疫监测修正免疫程序，使兔体免疫更科学、更合理。