指示功能
原生动物及微型后生动物多,说明水体自净程度高.污水处理过程中,微生物出现顺序：细菌 (植物) 鞭毛虫
变形虫 动物鞭毛虫 游泳型纤毛虫、吸管虫 固着型纤毛虫 轮虫幻灯片50：指示功能具体表现：a.判断污水处理程度或污泥培养程度.b.判断活性污泥和处理水质的好与坏.c.根据原生动物的个体形态变化判断进水水质变化和运行过程出现的问题.幻灯片51：2.净化功能活性污泥中含有一定量的原生动物,大部分为动物性营养,吞食有机物颗粒及其他较小的游离微生物.3.促进絮凝和沉淀作用
活性污泥法主要靠的是细菌（菌胶团）的絮凝和沉淀作用.但,原生动物对于污水的净化及污泥的絮凝、沉淀有着一定的促进作用.因为有的物种可以分泌一些粘性物质.