从临汾到祁门，旅客列车没有直达车，分别在太原和南京中转。从临汾出发，走大西客专到太原南，上石太客专到石家庄，转石德线到德州，走京沪线到南京，上宁芜线到芜湖，最后经皖赣线到祁门。
大西客运专线（大同-西安北）
大同-西安客运专线是中国一条建设中的连接山西省大同市与陕西省西安市的高速铁路。大西客专太原至西安段预计2014年7月通车，太原以北部分预计2015年通车。新建铁路大同至西安客运专线自原平西站引出，向南经忻州、阳曲后接入太原枢纽，自太原南站引出经介休、洪洞、临汾、运城后，在永济跨越黄河进入陕西省，经大荔、渭南、新临潼至西安北。本线自北向南经过恒山低中山区、忻定盆地、系舟山余脉丘陵区、太岳山低山丘陵区、临汾盆地、运城盆地、渭北黄土台塬及关中平原。正线全长859km，设计时速为200～250公里，于2009年12月3日动工。铁路沿线与石太客运专线、太中银铁路、郑西客运专线、西成客运专线连接。
石太客运专线(石家庄-太原)
又称石太高铁，是中国开工最早的高速铁路。是中国中长期铁路网规划的"四纵四横"客运专线的"一横"-青太客运专线的重要组成部分。沟通了华东和华北。2005年6月11日开工，正线全长225公里，总投资130亿元，双线电气化高速客运专线。于2009年4月1日正式通车，最高设计速度为250km/h，初期运营时速为200km/h，动车组主要采用CRH5型，CRH380AL型，及其他旅客列车。
石德线（石家庄-德州）
石德铁路修建于1940年6月，同年11月中旬全部竣工，次年2月15日交付运营。该路东连京沪线，经龙华，衡水，前磨头，辛集，晋州，藁城到达石家庄并与京广线、石太线相连接。石德铁路横贯华北中部平原，与胶济、石太两线贯通，连接晋、冀、鲁、豫四省交通。
京沪线（北京-上海）
是我国铁路的南北大动脉，全长1462km(其中正线长1429km)。全线自北向南分别经过北京市、天津市、河北省、山东省、安徽省、江苏省、上海市四省三市，纵贯海河、黄河、淮河、长江四大流域。京沪铁路是由过去的京山铁路、津浦铁路、沪宁铁路组成，南京长江大桥建成后联为一体。京沪铁路为国家I级电气铁路。京沪铁路经过东部人口密集、经济发达地区，沿线有许多重要工业城市，粮棉集中产区和鱼米之乡。南运货物以钢铁、煤炭、木材、棉花、油料和杂粮为主;北运货物以机械设备、机电设备、仪表、布匹、百货、面粉和茶叶等。京沪铁路连接了中国最大的两座城市，沿途大都为沿海经济发达地带，同时带动苏北、皖北等地区发展，因此成为中国目前最繁忙的铁路干线之一。
宁芜线（南京南-芜湖）
宁芜线全长125千米，是联结皖南至华东、上海的支线，也是华东一通道(沪宁线)和华东二通道(商杭线)的联络线，中国最繁忙的单线铁路，上海铁路局管辖，始建于1933年，时称江南铁路，曾是国内建设时间最短、每公里耗资最少的商办铁路。
皖赣线（芜湖-鹰潭）
皖赣铁路全长570千米，自安徽省芜湖经江西省景德镇到贵溪，沟通安徽、江西两省的铁路干线，为单线铁路。北边宁（南京）铜（陵）线相接、连宁芜铁路，南边连接浙赣铁路和鹰厦铁路。途中在宣城与宣杭线相交。沿线穿越皖南新安江谷地和赣东北丘陵区。途经黄山南麓，对开发黄山、屯溪、歙县一带旅游业有巨大意义。
K2665次 临汾-南京，换乘K25次 南京-祁门。K2665次是临汾始发到苏州的，路过南京。临汾始发时间为第一日中午12:05分，抵达南京是第二日10:50。K25次是南京始发到深圳的，南京始发时间为15:40，抵达祁门时间为当日晚上22:29。全程时间（包含换乘等候）共计34小时24分钟。此方案因为临汾与南京均是始发站，车票比较容易购买。临汾-南京票价：硬座 163.5元，硬卧 280.5元，软卧438.5元。南京-祁门票价：硬座 64.5元，硬卧 122.5元，软卧187元。比较好的车票组合是临汾-南京硬卧，南京到祁门硬座，票价345元。如果能够直接在临汾窗口购买联程票，根据客规票价还有里程递远递减的优惠。本方案在南京中转换乘需等待4小时50分钟。这个换乘时间对于汛期来说还是比较合适的，有充足的时间应对列车晚点。因此比较推荐。